首次运行LMLPHP创建项目时，系统会自动生成.htaccess文件，内容为"Deny from All"。这样使得项目目录对外不可见，项目文件得到更好的安全保护。如果您有足够的权限，可以将项目目录定义在非WEB目录下，这样会更加安全。

如果您的服务器环境不支持.htaccess文件，您可以尝试在项目目录中添加index.html或者default.html来隐藏项目目录文件。