位点特异性重组 和 DNA转座

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教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al

很多重要DNA重排是由两类重要遗传重组造成的

  • 保守位点特异性重组CSSR

    • 两端特定序列之间
    • 需要重组酶
    • 形成联会复合体
  • 转座重组 transpositional recombination
    • 不一定特定

一、保守性位点特异性重组

1、CSSR的三种类型

  • 不同分子间的重组造成插入
  • 同分子,通向位点间的重组造成缺失
  • 同分子,反向位点间的重组造成颠倒

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2、位点特异性重组酶通过一个蛋白质-DNA的共价中间体对DNA进行切割并重新连接

特异性重组酶的两个家族

  • 丝氨酸重组酶

    •   
  • 酪氨酸(tyr)重组酶

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3、位点特异性重组的生物学作用

  • 1、λ整合酶催化病毒基因在宿主细胞染色体上整合切除
  • 2、Hin重组酶颠倒一段DNA片段,特定基因开始表达
  • 3、重组酶将多聚环状DNA变成单体

二、转座

  • 转座相关序列可以占据物种基因组很大部分
  • 分为有发生复制的移位 和 不发生复制的移位

1、三类基本转座子MIT molecular Biology 笔记11 位点特异性重组 和 DNA转座-LMLPHP

  • DNA转座子
  • 类病毒反转录转座子
  • 多聚腺苷酸反转录转座子

2、转座子包括自主转座子和非自主转座子

  • 自主转座子有反向重复序列和转座酶基因

    • 类病毒反转录转座子还带有 逆转录酶
  • 非自主转座子只有反向重复序列

  

3、像基因的 聚腺苷反转录转座子

  • 没有末端重复序列:
  • ORF1 ORF2 编码反转录酶,核酸内切酶复合体

4、 DNA转座的剪切-粘贴 机制

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4、DNA转座中,断裂转移链的多种机制

  • TnsA酶切
  • 自攻击

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5、DNA复制性转座

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6、类病毒反转录转座子 和 反转录病毒 通过一个RNA中间体实现转座

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7、聚腺苷反转录转座子通过靶位点引导反转录转座

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8、转座子及其调控的实例

①对拷贝数的限制

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  • 当转座酶Tn10的 mRNA转录过多,会和反向DNA配对抑制
  • 转座酶mRNA 少时,不会配对,高效翻译蛋白

②靶位点免疫:避免转座到转座子自身上

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③小而富含基因的基因组 会有位点偏好性转座

  • 避免插入到重要区域

④LINE因子可以促进自身(poly-A转座子)转座,还能转座细胞mRNA

  • 转座的mRNA在基因组形成加工后的假基因

三、V (D) J 重组

  • 编码抗体的基因通过重组,表达各种各样的抗体蛋白

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复习题:

  • CSSR 与转座的区别
  • CSSR的三种类型
  • CSSR酶的两个家族,作用特点
  • 转座的三类基本子,结构特点
  • polyA转座子的结构特点
  • 自主转座子与非自主转座子的区别
  • DNA转座的剪切-粘贴机制
  • 转移时,单链切割后,断裂剩下的单链的三种机制
  • DNA复制性转座的过程
  • 类病毒反转录转座子的转座过程
  • polyA转座子的过程
  • 转座子对拷贝数的限制的调控
  • 靶位点免疫调控
  • V(D) J 重组的机制
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