常用的数据库操作包括：JDBC、EJB、JDO以及Hibernate。它的各有优缺点：
(1) JDBC：多数Java开发人员是用JDBC来和数据库进行通信，它可以通过DAO模式进行改善和提高。但这种方式在大型应用程序中不容易操作使用，且维护起来相当困难。
(2) EJB：EJB通常是在数据持久技术上的第二个选择，它是通过entitybeans来对数据进行持久化。首先就需要购买一个价位合理的EJB容器一J2EE应用服务器，也可以采用开源项目的免费EJB容器，比如JBOSS。但是很多商业EJB容器的性能和技术支持不太好，在EJB中实现JDBC也比较复杂。
(3) JDO：JDO的出现似乎有了一些改观，但是，JDO没有一个好的开源免费实现。好的产品部是商业产品，并且在国内没有销售和技术支持。JDO也不是一个轻量级封装．它建立的持久层框架，很不完善。再加上JDO的标准还很不完善以及严重的产品分裂问题，使得很多操作方式很是烦琐。
(4) Hibernate：Hibernate这种持久框架在某些方面有很大的不同，它不需要任何容器，提供简单易用的API，也解决了JDO的很多缺陷。作为一个良好的ORM ，它有如下特点：
透明地提供对象与关系数据库的映射，以统一的接口方式支持多种数据库。
缓存机制，复杂的缓存机制和锁定策略，使针对数据库操作大大减少。
开源免费的License，可以在需要的时候研究源代码，改写源代码，进行功能的定制。
轻量级封装，避免引入过多复杂的问题，容易调试，减轻程序员的负担。
具有可扩展性，API开放，当本身功能不够用的时候，可以自行编码扩展。
开发者活跃，产品有稳定的发展保障。