1、准备测试数据和脚本
本实验所使用的原始数据集为 SIFT1B ,关于该数据集的详细信息请参考:http://corpus-texmex.irisa.fr/。在本次测试中,我们提取了原始数据集中的 100 万条数据。
经实测,以下硬件配置可顺利完成实验:
测试工具下载:
- 100 万测试数据集下载地址:https://pan.baidu.com/s/1nVIIxO8MnOle339iYs2dUw
- 查询向量集下载地址:https://pan.baidu.com/s/1mBRM1cJZ6QWehDuddOYl4A
- 搜索结果对照 ( gound truth )下载地址:https://pan.baidu.com/s/1-95nJvW3vx2Cq9wqBWOFaA
- 测试脚本下载路径:https://gitee.com/milvus-io/bootcamp/tree/master/scripts
为方便存放测试数据和脚本,请创建名为 milvus_sift1m 的文件夹。利用前文提供的下载链接,将测试数据集下载到 milvus_sift1m 目录下:
- 测试数据集下载并解压完成之后,你将会看到一个名为 bvecs_data 的文件夹。该文件夹里面存放了 10 个 npy 文件,每个 npy 文件中存放了10 万条 uint8 格式的向量数据。
- 查询向量集下载完成之后,你会看到一个 query.npy 的文件,该文件里存放了 10,000 条实验中需要查询的向量。
- 对照数据( groundtruth )包含一个名为 ground_truth.txt 的文本文件,该文件里存放的是查询向量集中的每条向量的 top1000 相似向量的位置。
- 测试脚本会包含一个 python 程序 milvus_bootcamp.py 和一个 shell 脚本 get_id.sh。
获取完测试需要的数据和脚本后, milvus_sift1m 目录下应该存放有以下内容:
- 100 万测试数据: bvecs_data 文件夹
- 10,000 条查询向量集: query.npy
- 10,000 条查询向量集的 ground truth:ground_truth.txt
- 测试脚本:milvus_bootcamp.py 和 get_id.sh
注意
使用脚本 milvus_bootcamp.py 进行测试之前,请仔细阅读该脚本的 README 。并根据实际情况,对脚本中的相关变量值进行修改。使用脚本 get_id.sh 测试之前需要为它添加可执行权限,执行下述指令:
$ chmod +x get_id.sh
2、 配置 Milvus 参数
Milvus 可以根据数据分布和性能、准确性的要求灵活调整相关系统参数,以发挥产品的最佳性能。在此实验中,采用如下表所示的参数配置,就可以实现90%以上召回率。
配置文件: /home/$USER/milvus/conf/server_config.yaml
其余参数保持默认即可。配置文件参数修改完毕后,重启 Milvus Docker 使配置生效。
$ docker restart <container id>
3、 数据导入
导入数据之前,首先确保 bvecs_data 文件夹与测试脚本 milvus_bootcamp.py 都放在 milvus_sift1m 目录下,然后确认 Milvus 已经正常启动。( Milvus 安装及启动方法参见:Milvus 快速上手 )
进入 milvus_sift1m 目录,运行如下脚本:
$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 --index=ivfsq8 -t
脚本会创建一张名为 ann_1m_sq8 的表,它采用的索引类型为 ivfsq8 ,并导入数据:
上述过程完成之后,运行如下脚本以查看 Milvus 中存在的的表,以及表中的向量条数:
$ python3 milvus_bootcamp.py --show
$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 --rows
数据导入完成后,会在 milvus_sift1m 目录下产生一个名为 ann_1m_sq8_idmap.txt 的文件,该文件中存放的是 Milvus 为每一条向量分配的向量编号( ids )以及该向量的具体位置。
为了确保导入 Milvus 的数据已经全部建好索引,请进入 /home/$USER/milvus/db 目录,在终端输入如下命令:
$ sqlite3 meta.sqlite
进入交互式命令行之后,输入如下命令,检查向量数据表当前的状态:
sqlite> select * from TableFiles where table_id='ann_1m_sq8';
30|ann_1m_sq8|3|1565599487052367000|3|102400000|1565599495009366|1565599487052372|1190712
31|ann_1m_sq8|3|1565599495107862000|3|102400000|1565599502559292|1565599495107863|1190712
32|ann_1m_sq8|3|1565599502656466000|3|102400000|1565599510079453|1565599502656467|1190712
33|ann_1m_sq8|3|1565599510129972000|3|51200000|1565599513555987|1565599510129973|1190712
34|ann_1m_sq8|3|1565599513650120000|3|102400000|1565599521067974|1565599513650121|1190712
35|ann_1m_sq8|3|1565599521132604000|3|51200000|1565599524843984|1565599521132605|1190712
Milvus 会将一个向量数据表分成若干数据分片进行存储,因此查询命令会返回多条记录。其中第三列数字代表数据表采用的索引类型,数字 3 代表采用的是 ivfsq8 索引。第五列数字代表索引构建的情况,当这列数字为 3 时,代表相应的数据表分片上的索引已构建完毕。如果某个分片上的索引还没有构建完成,可以手动为这个数据分片建立索引。进入 milvus_sift1m 目录,运行如下脚本:
$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 --build
手动建立索引后,再次进入 sqlite 交互界面,确认所有数据分片都已经建好索引。如果想了解其他列数据代表的含义,请进入 /home/$USER/milvus/db 目录,在 sqlite 交互界面输入如下命令进行查看。
sqlite>.schema
4、准确性测试
SIFT1B 提供了10,000 条向量的查询向量集,并且对于每条查询向量都给出了该向量在不同规模数据集上的 top1000 ground truth。因此,可以方便地对 Milvus 查询结果的准确率进行计算。准确率计算公式为:
准确率= ( Milvus 查询结果与 Groundtruth 一致的向量个数 ) / ( query_records 的向量个数 * top_k )
(1)执行准确性测试脚本
从 10,000 条查询向量中随机取出 10 条向量,然后测试 Milvus 针对这 10 条向量的 top20 结果的准确率。进入 milvus_sift1m 目录,运行如下脚本:
$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 -q 10 -k 20 -s
(2)验证准确性测试结果
上述脚本运行完成后,将会生成一个名为 accuracy_results 的文件夹,在该文件夹下面会有一个名为 10_20_result.csv 的文件,文件里的内容如下图所示:
- nq: 代表的是第几个查询向量
- topk: 代表的是查询该向量的前 k 个相似的向量
- total_time: 代表整个查询花费的总时间,单位:秒
- avg_time: 代表每一条向量的平均查询时间,单位:秒
- recall: 代表 milvus 的查询结果与 ground truth 对比后的准确率
Milvus 查询准确率与搜索子空间( nprobe 参数)有很大关系。本次测试中 nprobe 设置为32,Milvus 查询准确率可以达到 90% 以上。可以通过增大 nprobe 值来实现更高的准确率但同时也会降低 Milvus 的查询性能。
因此,需要结合实际数据分布和业务SLA,调整搜索子空间大小以达到性能和准确性的平衡。
5、性能测试
为评估 Milvus 的查询性能,进入 milvus_sift1m 目录,运行如下脚本:
$ python3 milvus_bootcamp.py --table=ann_1m_sq8 -s
运行结束后,将会生成一个名为 performance_results 的文件夹,在该文件夹下会有一个名为 xxx_results.csv 的文件,'xxx' 代表执行命令的时间。文件内容如下图所示(未完全展示):
- nq: 代表要查询的向量数
- topk: 代表的是查询某个向量的前 k 个相似的向量
- total_time: 代表的是查询 nq个向量的前 k 个相似向量一共花费的时间,单位:秒
- avg_time: 代表的是查询一个向量的 topk 个相似向量的平均时间,单位:秒
注意
- milvus_bootcamp.py 中设置的待测试的 nq 为:1、50、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800。对于每一个 nq,milvus_bootcamp.py 设置的 topk 为:1、20、50、100、300、500、800、1000。
- Milvus 启动后,进行第一次向量检索时,需要花部分时间加载数据到内存。
- 如果两次测试间隔一段时间,Intel CPU可能降频至基础频率。性能测试时尽量连续运行测试案例。第一个测试案例可以运行两次,取第二次的运行时间。