cutadapt

参考:用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头

fastqc可以用于检测,检测出来了怎么办?

看了几篇高水平文章,有不少再用cutadapt,虽然有时候数据真的不错,但是还是要质控一下,修剪一下。

cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq

  

待续~

04-25 04:30