手把手教你看KEGG通路图！
怎么看KEGG中代谢通路图?
KEGG，Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因和基因组百科全书，是系统分析基因功能，联系基因组信息和功能信息的知识库。其中包含有大量的通路图，如下图所示：
1、代谢通路中各种符号标识：
代谢通路图中，一般就是酶，方框里面的数字代表EC编号；
小圆圈代表代谢物，点开会出现C00668的信息，C代表compound，00668是这种化合物在KEGG中的编号。
2、代谢通路中（绿）和（白）底框：
一般，KEGG中存在两种代谢图：
① reference pathway，根据已有的知识绘制的、概括的、详尽的具有一般参考意义的代谢图，为白色小框，在KEGG中名字以map开头，比如map00010；
② species-specific pathway，绿色小框为该物种特有的基因或酶，只有这些绿色的框有更详细的信息。KEGG中名字为特定物种种属英文缩写，比如酵母的糖酵解通路图，sce00010。
3、KEGG富集分析：
统计该物种的富集结果，红色边框的为上调的，绿色边框的为下调的。