最近发现了一门新语言 Julia , 这门编程语言据说大有取代 Python语言成为数据科学的大佬,但是细看发现最主要说的是这门编程语言运行速度比较快,并且在分布式和并行计算上比较有优势,这时候我就在想PYTHON语言是否也可以比较容易的搭建并行计算的平台呢,这一看还真有,就是 MPI4PY,这是个基于MPI的Python并行计算框架,其实细研究发现这个东西其实就是把MPI做了一下封装,然后把Python的消息用MPI进行传递。
由于 mpi4py 是在MPI 之上进行运作的,需要先安装MPI, 于是下面我们先安装MPI。
MPI 的old 版本下载地址:
http://www.mpich.org/static/downloads/
由于MPICH2的中文资料比较好找,于是本文安装MPICH2的版本,mpich2-1.0.4p1 。
mpich2-1.0.4p1
下载地址:
http://www.mpich.org/static/downloads/1.0.4p1/mpich2-1.0.4p1.tar.gz
下载后解压。
编译:
./configure --prefix=/opt/mpich2-1 --enable-f90 --enable-cxx --enable-threads=multiple --enable-sharedlibs=gcc --with-mpe
make sudo make install
本文的安装环境为 Ubuntu16.04, mpi的安装路径设置为 /opt/mpich2-1 。
其中,编译过程中报错, 最后发现是系统中还需要安装LIB库,于是,
sudo apt install mpich
不过据网上说只需要安装 libmpich-dev 就可以,不过没有考证。
安装结束后进行设置:
在 $HOME 文件夹下面的 .bashrc 文件中添加内容:
export PATH=/opt/mpich2-1/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/mpich2-1/lib:$LD_LIBRARY_PATH
source .bashrc 更新系统变量。
配置 mpd
cd $HOME touch .mpd.conf sudo chmod 600 .mpd.conf
修改内容: vim .mpd.conf MPD_SECRETWORD=mr45-j9z
mr45-j9z 为密码内容, 该内容可以自己随意设置。 启动 mpd
mpd &
以上为 MPICH2 安装的全部过程。 下面安装MPI4PY
sudo pip2 install mpi4py
测试 , mpi4py 是否安装成果:
测试文件:
# mpi_helloworld.py from mpi4py import MPI comm = MPI.COMM_WORLD
size = comm.Get_size()
rank = comm.Get_rank()
node_name = MPI.Get_processor_name() # get the name of the node print 'Hello world from process %d at %s.' % (rank, node_name)
运行:
mpiexec -n 4 python x.py
安装成功。
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MPICH2 安装成功测试:
创建文件 hello.c
#include "mpi.h"
#include <stdio.h>
#include <math.h>
int main (int argc, char **argv)
{
int myid, numprocs;
int namelen;
char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
MPI_Init (&argc, &argv);
MPI_Comm_rank (MPI_COMM_WORLD, &myid);
MPI_Comm_size (MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
MPI_Get_processor_name (processor_name, &namelen);
fprintf (stderr, "Hello World! Process %d of %d on %s\n", myid, numprocs, processor_name);
MPI_Finalize ();
return 0;
}
编译:
mpicc -o hello hello.c
执行:
mpirun -np 4 ./hello
安装成功。