特征渲染的滑珠气泡图是在滑珠散点图的基础上,添加散点大小与颜色参数,通过散点的尺寸与颜色表示两个额外的特征。
由于Matlab中没有现成的函数绘制特征渲染的滑珠气泡图,因此需要大家自行解决。
本文利用自己制作的BubbleScatter工具,进行特征渲染的滑珠气泡图的绘制,先来看一下成品效果:
特别提示:本期内容『数据+代码』已上传资源群中,加群的朋友请自行下载。有需要的朋友可以关注同名公号【阿昆的科研日常】,后台回复关键词【全家桶】查看加入方式。
1. 数据准备
此部分主要是读取原始数据并初始化绘图参数。
% 读取数据
load data.mat
% 初始化绘图参数
X = data;
ylabels = p;
f1 = SZ;
f2 = SZ2;
2. 颜色定义
作图不配色就好比做菜不放盐,总让人感觉少些味道。
但颜色搭配比较考验个人审美,需要多加尝试。
这里直接使用TheColor配色工具中的SCI权威配色库:
C = TheColor('sci',2068);
3. 特征渲染的滑珠气泡图绘制
调用‘BubbleScatter’命令,绘制初始特征渲染的滑珠气泡图。
[s,idx] = BubbleScatter(X,f1,f2);
bubblesize([5 20])
s.MarkerFaceAlpha = 0.8;
yl = ylabels(idx);
hTitle = title('BubbleScatter with feature');
hXLabel = xlabel('MeanDecreaseAccuracy');
hYLabel = ylabel('Product');
4. 细节优化
为了插图的美观与信息完整性,对图形细节等进行美化:
% 赋色
colormap(C)
% 坐标区调整
set(gca, 'Box', 'off', ... % 边框
'LineWidth', 1,... % 线宽
'XGrid', 'off', 'YGrid', 'on', ... % 网格
'TickDir', 'out', 'TickLength', [.005 .005], ... % 刻度
'XMinorTick', 'off', 'YMinorTick', 'off', ... % 小刻度
'XColor', [.1 .1 .1], 'YColor', [.1 .1 .1]) % 坐标轴颜色
% 坐标轴刻度调整
set(gca, 'YTick', 1:16,...
'Ylim' , [0.5 15.5], ...
'Xlim' , [-0.05 1.05], ...
'XTick', 0:0.2:1,...
'yticklabel',yl)
% 添加图例
blgd = bubblelegend('Style','vertical',...
'BubbleSizeOrder','descending',...
'box','off',...
'Location','northeastoutside',...
'NumBubbles',3,... ...
'FontName', 'Helvetica',...
'FontSize', 9);
colorbar('Position',[0.79,0.11,0.03,0.4])
% 字体和字号
set(gca, 'FontName', 'Arial', 'FontSize', 9)
set([hXLabel, hYLabel], 'FontSize', 11, 'FontName', 'Arial')
set(hTitle, 'FontSize', 12, 'FontWeight' , 'bold')
% 背景颜色
set(gcf,'Color',[1 1 1])
% 添加上、右框线
xc = get(gca,'XColor');
yc = get(gca,'YColor');
unit = get(gca,'units');
ax = axes( 'Units', unit,...
'Position',get(gca,'Position'),...
'XAxisLocation','top',...
'YAxisLocation','right',...
'Color','none',...
'XColor',xc,...
'YColor',yc);
set(ax, 'linewidth',1,...
'XTick', [],...
'YTick', []);
设置完毕后,以期刊所需分辨率、格式输出图片。
%% 图片输出
figW = figureWidth;
figH = figureHeight;
set(figureHandle,'PaperUnits',figureUnits);
set(figureHandle,'PaperPosition',[0 0 figW figH]);
fileout = 'test';
print(figureHandle,[fileout,'.png'],'-r300','-dpng');
以上。