E 题 出血性脑卒中临床智能诊疗建模

三、请建模回答如下问题
1血肿扩张风险相关因素探索建模。
a)请根据“表1”(字段:入院首次影像检查流水号,发病到首次影像检查时间间隔),“表2”(字段:各时间点流水号及对应的HM_volume),判断患者sub001至sub100发病后48小时内是否发生血肿扩张事件。
结果填写规范:1是0否,填写位置:“表4”C字段(是否发生血肿扩张)。
如发生血肿扩张事件,请同时记录血肿扩张发生时间。
结果填写规范:如10.33小时,填写位置:“表4”D字段(血肿扩张时间)。
是否发生血肿扩张可根据血肿体积前后变化,具体定义为:后续检查比首次检查绝对体积增加≥6 mL或相对体积增加≥33%。
注:可通过流水号至“附表1-检索表格-流水号vs时间”中查询相应影像检查时间点,结合发病到首次影像时间间隔和后续影像检查时间间隔,判断当前影像检查是否在发病48小时内。

E思路:https://www.jdmm.cc/file/2709593/
E代码:https://www.jdmm.cc/file/2709599/

根据问题描述,需要根据“表1”和“表2”中的数据来判断患者sub001至sub100发病后48小时内是否发生血肿扩张事件。如果发生血肿扩张事件,还需要记录血肿扩张发生时间。判断是否发生血肿扩张的具体定义为:后续检查比首次检查绝对体积增加≥6 mL或相对体积增加≥33%。可以通过流水号至“附表1-检索表格-流水号vs时间”中查询相应影像检查时间点,结合发病到首次影像时间间隔和后续影像检查时间间隔,判断当前影像检查是否在发病48小时内。如果发生血肿扩张事件,需要在“表4”中的C字段填写1,否则填写0。同时,在“表4”中的D字段记录血肿扩张发生时间,格式为小时数,例如10.33小时。

数据预处理:首先需要对提供的数据进行预处理,包括数据清洗、缺失值处理、异常值处理等。同时,需要将数据按照时间顺序排序,以便后续的分析和建模。

特征提取:根据问题要求,需要提取入院首次影像检查流水号、发病到首次影像检查时间间隔和各时间点流水号及对应的HM_volume等特征。
还需要计算血肿体积前后的变化量,以便判断是否发生血肿扩张事件。

建立模型:根据提取的特征,可以选择合适的模型进行建模。例如,可以使用逻辑回归、支持向量机、决策树等机器学习算法进行建模。在建模过程中,需要将数据集分为训练集和测试集,以便评估模型的性能和泛化能力。

建立模型后,需要对模型进行评估,包括准确率、召回率、F1值等指标。同时,还需要进行交叉验证和调参等操作,以提高模型的性能和泛化能力。根据问题要求,在“表4”中的C字段填写是否发生血肿扩张事件的结果,如果发生血肿扩张事件,还需要在“表4”中的D字段记录血肿扩张发生时间。

b)请以是否发生血肿扩张事件为目标变量,基于“表1” 前100例患者(sub001至sub100)的个人史,疾病史,发病相关(字段E至W)、“表2”中其影像检查结果(字段C至X)及“表3”其影像检查结果(字段C至AG,注:只可包含对应患者首次影像检查记录)等变量,构建模型预测所有患者(sub001至sub160)发生血肿扩张的概率。
注:该问只可纳入患者首次影像检查信息。
结果填写规范:记录预测事件发生概率(取值范围0-1,小数点后保留4位数);填写位置:“表4”E字段(血肿扩张预测概率)。

根据问题描述,需要以是否发生血肿扩张事件为目标变量,基于“表1”前100例患者(sub001至sub100)的个人史、疾病史、发病相关(字段E至W)、“表2”中其影像检查结果(字段C至X)及“表3”其影像检查结果(字段C至AG,注:只可包含对应患者首次影像检查记录)等变量,构建模型预测所有患者(sub001至sub160)发生血肿扩张的概率。需要注意的是,该问题只可纳入患者首次影像检查信息。
在数据预处理阶段,首先需要对提供的数据进行预处理,包括数据清洗、缺失值处理、异常值处理等。

本题的特征提取,根据问题要求,需要提取个人史、疾病史、发病相关、影像检查结果等特征。同时,还需要将是否发生血肿扩张事件作为目标变量。

根据提取的特征,可以选择合适的模型进行建模。例如,可以使用逻辑回归、支持向量机、决策树等机器学习算法进行建模。在建模过程中,需要将数据集分为训练集和测试集,以便评估模型的性能和泛化能力。

用建立好的模型对所有患者(sub001至sub160)进行预测,得到每个患者发生血肿扩张的概率。
根据问题要求,在“表4”中的E字段填写每个患者发生血肿扩张的预测概率。预测概率的取值范围为0到1,小数点后保留4位数。 根据建立的模型预测每个患者发生血肿扩张的概率,并将结果填写在“表4”中的E字段,按照规范记录预测事件发生概率。

2血肿周围水肿的发生及进展建模,并探索治疗干预和水肿进展的关联关系。
a)请根据“表2”前100个患者(sub001至sub100)的水肿体积(ED_volume)和重复检查时间点,构建一条全体患者水肿体积随时间进展曲线(x轴:发病至影像检查时间,y轴:水肿体积,y=f(x)),计算前100个患者(sub001至sub100)真实值和所拟合曲线之间存在的残差。
结果填写规范:记录残差,填写位置“表4”F字段(残差(全体))。
根据问题描述,需要根据“表2”前100个患者(sub001至sub100)的水肿体积(ED_volume)和重复检查时间点,构建一条全体患者水肿体积随时间进展曲线,并计算前100个患者(sub001至sub100)真实值和所拟合曲线之间存在的残差。需要注意的是,结果需要记录残差,并填写在“表4”中的F字段(残差(全体))。

根据问题要求,需要提取水肿体积(ED_volume)和重复检查时间点等特征。同时,需要将这些特征按照时间顺序进行排序。
可以先绘制图像,观察两者的关系。
根据提取的特征,可以选择合适的模型进行建模,本题需要根据图像大致判断拟合的曲线形式。建立模型后,需要对模型进行评估。
使用建立好的模型对所有患者进行预测,并得到残差。

b)请探索患者水肿体积随时间进展模式的个体差异,构建不同人群(分亚组:3-5个)的水肿体积随时间进展曲线,并计算前100个患者(sub001至sub100)真实值和曲线间的残差。
结果填写规范:记录残差,填写位置“表4”G字段(残差(亚组)),同时将所属亚组填写在H段(所属亚组)。

这题与(a)类似,根据问题要求,需要特征,并先绘制图像,观察两者的关系。
根据提取的特征,可以选择合适的模型进行建模,本题需要根据图像大致判断拟合的曲线形式。建立模型后,需要对模型进行评估。
使用建立好的模型对所有患者进行预测,并得到残差。
c)请分析不同治疗方法(“表1”字段Q至W)对水肿体积进展模式的影响。
根据问题描述,需要分析不同治疗方法(“表1”字段Q至W)对水肿体积进展模式的影响。具体来说,需要对不同治疗方法下的水肿体积进展模式进行比较和分析,以探究不同治疗方法对水肿体积进展的影响。
特征提取:根据问题要求,需要提取水肿体积(ED_volume)和治疗方法(表1字段Q至W)等特征。同时,需要将这些特征按照时间顺序进行排序,以便后续的分析和建模。

根据提取的特征,可以对不同治疗方法下的水肿体积进展模式进行比较和分析。例如,可以计算不同治疗方法下的水肿体积变化率、水肿体积增长速率等指标,并进行统计分析和可视化展示。

这个影响可以有多种理解,比如你构建得到了两者的关系式,比如你绘制了可视化图表并进行了文字说明,比如你建立机器学习预测的模型等等,言之有理即可。

d)请分析血肿体积、水肿体积及治疗方法(“表1”字段Q至W)三者之间的关系。
根据问题描述,需要分析血肿体积、水肿体积及治疗方法(“表1”字段Q至W)三者之间的关系。具体来说,需要探究血肿体积、水肿体积和治疗方法对出血性脑卒中患者预后的影响,并分析它们之间的关系。
相关性最基本的是基于相关性分析得到
三者的相关关系可以采用一个含这三个变量的公式表示
当然也可以用图表进行可视化,推荐python的seaborn库

3出血性脑卒中患者预后预测及关键因素探索。
a)请根据前100个患者(sub001至sub100)个人史、疾病史、发病相关(“表1”字段E至W)及首次影像结果(表2,表3中相关字段)构建预测模型,预测患者(sub001至sub160)90天mRS评分。
注:该问只可纳入患者首次影像检查信息。
结果填写规范:记录预测mRS结果,0-6,有序等级变量。填写位置“表4”I字段(预测mRS(基于首次影像))。
根据问题描述,需要根据前100个患者(sub001至sub100)个人史、疾病史、发病相关(“表1”字段E至W)及首次影像结果(表2,表3中相关字段构建预测模型,预测患者(sub001至sub160)90天mRS评分。同时,需要将预测结果填写在“表4”I字段中。
这题难度不高
根据问题要求,需要提取个人史、疾病史、发病相关和首次影像结果等特征。
根据提取的特征,可以对出血性脑卒中患者的预后进行分析和建模。例如,可以使用机器学习算法(如决策树、随机森林、神经网络等)进行建模,并使用交叉验证等方法对模型进行评估和优化。
根据建立的模型,可以对患者的90天mRS评分进行预测。预测结果应该记录在“表4”I字段中,格式为0-6的有序等级变量。
需要注意的是,该问题只可纳入患者首次影像检查信息,因此在特征提取和模型建立过程中,需要仅考虑首次影像结果
b)根据前100个患者(sub001至sub100)所有已知临床、治疗(表1字段E到W)、表2及表3的影像(首次+随访)结果,预测所有含随访影像检查的患者(sub001至sub100,sub131至sub160)90天mRS评分。
结果填写规范:记录预测mRS结果,0-6,有序等级变量。填写位置“表4”J字段(预测mRS)。
根据问题要求,需要提取临床、治疗和影像等特征根据提取的特征,可以对出血性脑卒中患者的预后进行分析和建模。如决策树、随机森林、神经网络等进行建模
根据建立的模型,可以对所有含随访影像检查的患者(sub001至sub100,sub131至sub160)的90天mRS评分进行预测。预测结果应该记录在“表4”J字段中,格式为0-6的有序等级变量。

需要注意的是,该问题需要考虑所有已知临床、治疗和影像等特征,
c)请分析出血性脑卒中患者的预后(90天mRS)和个人史、疾病史、治疗方法及影像特征(包括血肿/水肿体积、血肿/水肿位置、信号强度特征、形状特征)等关联关系,为临床相关决策提出建议。
关联关系可以通过机器学习中可解释性的内容来展示,如特征重要性等
这个是最推荐的方法
当然也可以采用公式拟合、相关性分析等
决策就是需要根据题目的结果进行文字解释并给出具体策略。

四、附件
表1-患者列表及临床信息.xlsx
表2-患者影像信息血肿及水肿的体积及位置.xlsx
表3-患者影像信息血肿及水肿的形状及灰度分布.xlsx
表4-答案文件.xlsx
附表1-检索表格-流水号vs时间.xlsx
附件2-相关概念.docx

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