用Networkx实现不同层数的六方晶格

问题描述

如何扩展此代码，以包括不同数量的六角形层？我需要一个给定层数m的六角形点阵的图表。M=1表示1个边为1、中心位于原点的正六边形，对于m=2，在初始正六边形周围添加6个正六边形，对于m=3，添加第三层六边形，依此类推。

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
G = nx.hexagonal_lattice_graph(m=2,n=3, periodic=False, with_positions=True,
                               create_using=None)
pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos')
nx.draw(G, pos=pos, with_labels=True)
plt.show()

推荐答案

一个有趣的问题！我花的时间比我预想的要长一点。基本上，函数hexagonal_lattice_graph()生成一个m x n矩形六边形网格。因此，任务是首先绘制一个大网格，然后删除位于最外层之外的节点。我使用距离来决定保留哪些节点，删除哪些节点。这更加棘手，因为奇数和偶数m的行为略有不同。因此，必须仔细计算中心坐标。

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt


def node_dist(x,y, cx, cy):
    """Distance of each node from the center of the innermost layer"""
    return abs(cx-x) + abs(cy-y)


def remove_unwanted_nodes(G, m):
    """Remove all the nodes that don't belong to an m-layer hexagonal ring."""

    #Compute center of all the hexagonal rings as cx, cy
    cx, cy = m-0.5, 2*m -(m%2) #odd is 2m-1, even is 2m

    #in essence, we are converting from a rectangular grid to a hexagonal ring... based on distance.
    unwanted = []
    for n in G.nodes:
        x,y = n
        #keep short distance nodes, add far away nodes to the list called unwanted
        if node_dist(x,y, cx, cy) > 2*m:
            unwanted.append(n)

    #now we are removing the nodes from the Graph
    for n in unwanted:
        G.remove_node(n)

    return G



##################
m = 4 #change m here. 1 = 1 layer, single hexagon.
G = nx.hexagonal_lattice_graph(2*m-1,2*m-1, periodic=False,
                               with_positions=True,
                               create_using=None)
pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos')
G = remove_unwanted_nodes(G, m)

#render the result
plt.figure(figsize=(9,9))
nx.draw(G, pos=pos, with_labels=True)
plt.axis('scaled')
plt.show()

这将为m=3生成以下内容：

对于m=4：

欢迎来到So！希望上面的解决方案是明确的，并帮助您继续前进。

这篇关于用Networkx实现不同层数的六方晶格的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持！