本文介绍了R用聚类绘制热图，但隐藏树状图的处理方法，对大家解决问题具有一定的参考价值，需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧！
问题描述
默认情况下，R的 heatmap 将群集行和列:
By default, R's heatmap will cluster rows and columns:
mtscaled = as.matrix(scale(mtcars))
heatmap(mtscaled, scale='none')
我可以禁用群集:
heatmap(mtscaled, Colv=NA, Rowv=NA, scale='none')
然后树状图消失:
但是现在数据不再聚类了.
But now the data is not clustered anymore.
我不希望显示树状图，但是我仍然希望对行和/或列进行聚类.我该怎么办?
I don't want the dendrograms to be shown, but I still want the rows and/or columns to be clustered. How can I do this?
我想要的示例:
推荐答案
library(gplots)
heatmap.2(mtscaled,dendrogram='none', Rowv=TRUE, Colv=TRUE,trace='none')
Rowv -is为TRUE，表示树状图是根据行均值进行计算和重新排序的.
Rowv -is TRUE, which implies dendrogram is computed and reordered based on row means.
Colv -列应与行相同.
这篇关于R用聚类绘制热图，但隐藏树状图的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持！