本文介绍了如何不使用Snakemake撤销更新的文件的处理方法，对大家解决问题具有一定的参考价值，需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧！
问题描述
即使已经有输出文件了，Snakemake也只想重新执行我的所有管道，因为我已经修改了第一个输出文件之一.
Even if output files are already here, Snakemake want to reexecute all of my pipeline only because I have modified one of the first output files.
我通过使用"np --reason"运行Snakemake来弄清楚:原因:输入文件被另一个作业更新:Mapping/col.sorted.bam
I figure out by running Snakemake with "np --reason": reason: Input files updated by another job: Mapping/col.sorted.bam
如何强制Snakemake不重新运行此更新文件?
How can I force Snakemake to not rerun this update file ?
谢谢
推荐答案
您可以使用选项-touch 将其标记为最新:
You can use the option --touch to mark them up to date:
请注意，这将触及您的所有文件，并因此修改时间戳以使其恢复原状.
Beware that this will touch all your files and thus modify the timestamps to put them back in order.
这篇关于如何不使用Snakemake撤销更新的文件的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持！