简单易用的序列处理工具SeqHandler-v1.0.0介绍

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在实际工作工程中经常需要处理一些序列,需要的功能可能也是极其简单的,比如:查看长度、ATCG各个碱基的含量、GC含量等等。我的做法是把那个需要拷贝到ipython(一个Python的解释工具),然后再各种操作,操作到了发现这些东西都是重复性的,而且是很简单的,于是就萌生了做一个简单的序列处理工具的想法。

现在SeqHandler的功能有限,仅有:长度、ATCG含量统计、GC含量统计、反向互补、截取子序列功能,大家对功能提一些建议。

使用的方法也是很简单地:

  1. 第一步,打开序列文件(目前支持fa、fq、gb),支持一个文件里面含有多条序列
  2. 选中序列
  3. 各种操作
    ][3]
03-05 15:16