我正在测试parLapplyLB()
函数,以了解它如何平衡负载。但是我没有看到任何平衡。例如,
cl <- parallel::makeCluster(2)
system.time(
parallel::parLapplyLB(cl, 1:4, function(y) {
if (y == 1) {
Sys.sleep(3)
} else {
Sys.sleep(0.5)
}}))
## user system elapsed
## 0.004 0.009 3.511
parallel::stopCluster(cl)
如果它确实在平衡负载,则休眠3秒的第一个作业(作业1)将在第一个节点上,其他三个作业(作业2:4)将在另一个节点上合计1.5秒。总共,系统时间应仅为3秒。
相反,我认为作业1和2分配给节点1,作业3和4分配给节点2。这导致总时间为3 + 0.5 = 3.5秒。如果我们使用
parLapply()
而不是parLapplyLB()
运行与上面相同的代码,我们将获得大约3.5秒的相同系统时间。我不明白或做错了什么?
最佳答案
注意:自R-3.5.0起,已修复了OP指出并在下面说明的行为/错误。如当时R的NEWS
文件中所述:
* parLapplyLB and parSapplyLB have been fixed to do load balancing
(dynamic scheduling). This also means that results of
computations depending on random number generators will now
really be non-reproducible, as documented.
原始答案(现在仅与
对于像您这样的任务(就此而言,对于我需要使用 parallel 的任何任务),
parLapplyLB
并不是真正适合该工作的工具。要了解为什么不这样做,请查看其实现方式:parLapplyLB
# function (cl = NULL, X, fun, ...)
# {
# cl <- defaultCluster(cl)
# do.call(c, clusterApplyLB(cl, x = splitList(X, length(cl)),
# fun = lapply, fun, ...), quote = TRUE)
# }
# <bytecode: 0x000000000f20a7e8>
# <environment: namespace:parallel>
## Have a look at what `splitList()` does:
parallel:::splitList(1:4, 2)
# [[1]]
# [1] 1 2
#
# [[2]]
# [1] 3 4
问题在于,它首先将作业列表拆分为相等大小的子列表,然后将其分配到节点之间,每个节点在其给定的子列表上运行
lapply()
。因此,在这里,您的第一个节点在第一个和第二个输入上运行作业,而第二个节点在第三个和第四个输入上运行作业。相反,请使用功能更强大的
clusterApplyLB()
,它可以按您希望的那样工作:system.time(
parallel::clusterApplyLB(cl, 1:4, function(y) {
if (y == 1) {
Sys.sleep(3)
} else {
Sys.sleep(0.5)
}}))
# user system elapsed
# 0.00 0.00 3.09
关于r - 为什么parLapplyLB实际上没有平衡负载?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/38230831/