r - ggplot2密度曲线下的阴影区域(按组)

我有这个数据框：

set.seed(1)
x <- c(rnorm(50, mean = 1), rnorm(50, mean = 3))
y <- c(rep("site1", 50), rep("site2", 50))
xy <- data.frame(x, y)

我做了这个密度图：

library(ggplot2)
ggplot(xy, aes(x, color = y)) + geom_density()

对于site1，我需要遮盖曲线下大于数据1％的区域。对于site2，我需要对曲线下
我希望剧情看起来像这样（照片购物）。经历了堆栈溢出之后，我知道其他人问过如何对曲线下的部分区域进行着色，但是我无法弄清楚如何对组下的曲线下的区域进行着色。

最佳答案

这是一种方法（正如@joran所说，这是响应here的扩展）：

#  same data, just renaming columns for clarity later on
#  also, use data tables
library(data.table)
set.seed(1)
value <- c(rnorm(50, mean = 1), rnorm(50, mean = 3))
site  <- c(rep("site1", 50), rep("site2", 50))
dt    <- data.table(site,value)
#  generate kdf
gg <- dt[,list(x=density(value)$x, y=density(value)$y),by="site"]
#  calculate quantiles
q1 <- quantile(dt[site=="site1",value],0.01)
q2 <- quantile(dt[site=="site2",value],0.75)
# generate the plot
ggplot(dt) + stat_density(aes(x=value,color=site),geom="line",position="dodge")+
  geom_ribbon(data=subset(gg,site=="site1" & x>q1),
              aes(x=x,ymax=y),ymin=0,fill="red", alpha=0.5)+
  geom_ribbon(data=subset(gg,site=="site2" & x<q2),
              aes(x=x,ymax=y),ymin=0,fill="blue", alpha=0.5)

产生这个：

关于r - ggplot2密度曲线下的阴影区域(按组)，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/20355849/