使用scikit时,我有2个关于PCA的问题。

假设我有以下数据:

fullmatrix =[[2.5, 2.4],
             [0.5, 0.7],
             [2.2, 2.9],
             [1.9, 2.2],
             [3.1, 3.0],
             [2.3, 2.7],
             [2.0, 1.6],
             [1.0, 1.1],
             [1.5, 1.6],
             [1.1, 0.9]]


现在,我进行PCA计算:

from sklearn.decomposition import PCA as PCA

sklearn_pca = PCA()
Y_sklearn = sklearn_pca.fit_transform(fullmatrix)
print Y_sklearn  # Y_sklearn is now the Data transformed with 2 eigenvectors

sklearn_pca.explained_variance_ratio_  # variance explained by each eigenvector
print sklearn_pca.explained_variance_ratio_

sklearn_pca.components_ # eigenvectors order by highest eigenvalue
print sklearn_pca.components_


第一个问题:
如何将这个Y_sklearn投影回原始比例? (我知道我们应该使用所有特征向量来获取与全矩阵相同的数据,这只是为了检查是否正确完成)。

第二个问题:
如何输入有关“ sklearn_pca.explained_variance_ratio_”的最小可接受总方差的阈值?例如,假设我要一直使用特征向量,直到达到95%以上的总explained_variance_ratio_。在这种情况下很容易,我们只使用第一个特征向量即可解释为0.996318131%。但是,我们如何才能以更自动化的方式做到这一点呢?

最佳答案

第一:sklearn_pca.inverse_transform(Y_sklearn)

第二:

thr = 0.95
# Is cumulative sum exceeds some threshold
is_exceeds = np.cumsum(sklearn_pca.explained_variance_ratio_) >= thr
# Which minimal index provides such variance
# We need to add 1 to get minimum number of eigenvectors for saving this variance
k = np.min(np.where(is_exceeds))+1
# Or you can just initialize your model with thr parameter
sklearn_pca = PCA(n_components = thr)

关于python - 将PCA项目重新设置为原始比例,并带有explain_variance_ratio_条件,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/33021806/

10-12 21:27