我挖掘了很多线程,但是他们都没有解决这个问题。
我对addind字符串chr到每一行的开头很感兴趣。
文件由制表符分隔,看起来像:
re1 1 AGT
re2 1 AGT
re3 2 ACGTCA
re12 3 ACGTACT
我需要的是:
re1 chr1 AGT
re2 chr1 AGT
re3 chr2 ACGTCA
re12 chr3 ACGTACT
可以在bash oneliner中
非常感谢您的帮助,
干杯,
伊雷克
最佳答案
那这个呢?
$ awk '$2="chr"$2' file
re1 chr1 AGT
re2 chr1 AGT
re3 chr2 ACGTCA
re12 chr3 ACGTACT
解释
使用
$2="chr"$2
,我们将chr
添加到第二个字段。然后,我们不需要任何其他命令即可获得所需的输出,因为awk的默认行为是print $0
。要确保OFS(输出字段分隔符)是一个选项卡,您可以执行以下操作:
$ awk 'BEGIN{OFS="\t"}$2="chr"$2' file
re1 chr1 AGT
re2 chr1 AGT
re3 chr2 ACGTCA
re12 chr3 ACGTACT
关于string - 在列开头的每一行中添加字符串,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/18061606/