我想使用 R 包 rsample
来生成我的数据的重采样。
该包提供了函数 rolling_origin
来生成保持数据时间序列结构的重采样。这意味着训练数据(在名为 analysis
的包中)总是在测试数据( assessment
)的过去。
另一方面,我想执行数据的块样本。这意味着在采样期间行组保持在一起。这可以使用函数 group_vfold_cv
来完成。人们可以想到的团体是几个月。说,我们想要做时间序列交叉验证,总是保持几个月的时间。
有没有办法在 rsample
中结合这两种方法?
我为每个程序单独举例:
## generate some data
library(tidyverse)
library(lubridate)
library(rsample)
my_dates = seq(as.Date("2018/1/1"), as.Date("2018/8/20"), "days")
some_data = data_frame(dates = my_dates)
some_data$values = runif(length(my_dates))
some_data = some_data %>% mutate(month = as.factor(month(dates)))
这给出了以下形式的数据
A tibble: 232 x 3
dates values month
<date> <dbl> <fctr>
1 2018-01-01 0.235 1
2 2018-01-02 0.363 1
3 2018-01-03 0.146 1
4 2018-01-04 0.668 1
5 2018-01-05 0.0995 1
6 2018-01-06 0.163 1
7 2018-01-07 0.0265 1
8 2018-01-08 0.273 1
9 2018-01-09 0.886 1
10 2018-01-10 0.239 1
然后我们可以例如生成需要 20 周数据并在 future 5 周进行测试的样本(参数
skip
跳过一些额外的行):rolling_origin_resamples <- rolling_origin(
some_data,
initial = 7*20,
assess = 7*5,
cumulative = TRUE,
skip = 7
)
我们可以用下面的代码检查数据,看不到重叠:
rolling_origin_resamples$splits[[1]] %>% analysis %>% tail
# A tibble: 6 x 3
dates values month
<date> <dbl> <fctr>
1 2018-05-15 0.678 5
2 2018-05-16 0.00112 5
3 2018-05-17 0.339 5
4 2018-05-18 0.0864 5
5 2018-05-19 0.918 5
6 2018-05-20 0.317 5
### test data of first split:
rolling_origin_resamples$splits[[1]] %>% assessment
# A tibble: 6 x 3
dates values month
<date> <dbl> <fctr>
1 2018-05-21 0.912 5
2 2018-05-22 0.403 5
3 2018-05-23 0.366 5
4 2018-05-24 0.159 5
5 2018-05-25 0.223 5
6 2018-05-26 0.375 5
或者,我们可以按月拆分:
## sampling by month:
gcv_resamples = group_vfold_cv(some_data, group = "month", v = 5)
gcv_resamples$splits[[1]] %>% analysis %>% select(month) %>% summary
gcv_resamples$splits[[1]] %>% assessment %>% select(month) %>% summary
最佳答案
正如@missuse 的解决方案的评论中所讨论的,实现这一点的方法记录在 github 问题中:https://github.com/tidymodels/rsample/issues/42
本质上,这个想法是首先嵌套在你的“块”上,然后 rolling_origin()
将允许你滚动它们,保持完整的块完好无损。
library(dplyr)
library(lubridate)
library(rsample)
library(tidyr)
library(tibble)
# same data generation as before
my_dates = seq(as.Date("2018/1/1"), as.Date("2018/8/20"), "days")
some_data = data_frame(dates = my_dates)
some_data$values = runif(length(my_dates))
some_data = some_data %>% mutate(month = as.factor(month(dates)))
# nest by month, then resample
rset <- some_data %>%
group_by(month) %>%
nest() %>%
rolling_origin(initial = 1)
# doesn't show which month is which :(
rset
#> # Rolling origin forecast resampling
#> # A tibble: 7 x 2
#> splits id
#> <list> <chr>
#> 1 <S3: rsplit> Slice1
#> 2 <S3: rsplit> Slice2
#> 3 <S3: rsplit> Slice3
#> 4 <S3: rsplit> Slice4
#> 5 <S3: rsplit> Slice5
#> 6 <S3: rsplit> Slice6
#> 7 <S3: rsplit> Slice7
# only January (31 days)
analysis(rset$splits[[1]])$data
#> [[1]]
#> # A tibble: 31 x 2
#> dates values
#> <date> <dbl>
#> 1 2018-01-01 0.373
#> 2 2018-01-02 0.0389
#> 3 2018-01-03 0.260
#> 4 2018-01-04 0.803
#> 5 2018-01-05 0.595
#> 6 2018-01-06 0.875
#> 7 2018-01-07 0.273
#> 8 2018-01-08 0.180
#> 9 2018-01-09 0.662
#> 10 2018-01-10 0.849
#> # ... with 21 more rows
# only February (28 days)
assessment(rset$splits[[1]])$data
#> [[1]]
#> # A tibble: 28 x 2
#> dates values
#> <date> <dbl>
#> 1 2018-02-01 0.402
#> 2 2018-02-02 0.556
#> 3 2018-02-03 0.764
#> 4 2018-02-04 0.134
#> 5 2018-02-05 0.0333
#> 6 2018-02-06 0.907
#> 7 2018-02-07 0.814
#> 8 2018-02-08 0.0973
#> 9 2018-02-09 0.353
#> 10 2018-02-10 0.407
#> # ... with 18 more rows
由 reprex package (v0.2.0) 于 2018 年 8 月 28 日创建。
关于r - 在 rsample 中结合滚动原点预测重采样和组 V 折叠交叉验证,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/51925991/