我在scipy中使用griddata函数对3维和4维数据进行插值。它像一个冠军一样工作,除了它返回一堆NaN,因为我需要的某些点不在输入数据的范围之内。鉴于N-d数据无论如何都只能在“线性”模式内插下工作,因此让griddata进行外插而不是仅仅返回NaN应该是很容易的。有没有人这样做或找到了解决方法?需要说明的是:我具有非结构化数据,因此无法使用任何需要常规网格的函数。
谢谢!
亚历克斯
最佳答案
用scipy.interpolate.Rbf插值和外推3、4或实际上任何维度的数据的一种可能性
为了方便起见,get_data()
函数和plot_3d()
函数附加到末尾。
示例数据
示例数据看起来像这样(第四维w用一种颜色显示)。数据间隔不规则且未网格化。
x, y, z, w = get_data(N=200)
plot_3d(x, y, z, w)
3D内插和外推首先,让我们设置新的x和y坐标。为了使这个更有趣,让我们外推到负x和负y方向。这形成了新的感兴趣的x和y范围。
xs = np.linspace(-10, 20) # some extrapolation to negative numbers
ys = np.linspace(-10, 20) # some extrapolation to negative numbers
xnew, ynew = np.meshgrid(xs, ys)
xnew = xnew.flatten()
ynew = ynew.flatten()
用scipy.interpolate.Rbf进行插值。现在,from scipy.interpolate import Rbf
rbf3 = Rbf(x, y, z, function="multiquadric", smooth=5)
znew = rbf3(xnew, ynew)
plot_3d(xnew, ynew, znew)
x
,y
)被视为节点的坐标。 function
参数之前的最后一个参数是要插值的“值”(现在为z
)。 function
参数可用于控制如何对值进行插值。这会影响结果,因此请使用它来处理您的数据。smooth
参数可用于消除数据中的某些噪声。如果smooth
为零,则结果为插值;否则为0。它将遍历您的所有数据点。如果为正值,则数据更平滑。这会影响结果,因此请使用它来处理您的数据。function
和smooth
以获得所需的结果。通常,不应将数据外推“太多”(如本例所示)增加第四维
也可以内插和外推到第四维。方法如下:
rbf4 = Rbf(x, y, z, w, function="thin_plate", smooth=5)
wnew = rbf4(xnew, ynew, znew)
plot_3d(xnew, ynew, znew, wnew)
Rbf
实例,并使用通过znew
(在3d中进行插值)计算出的rbf3
。 function
更改为"thin_plate"
,因为从外观上看,此数据集的性能更好。 附录:
get_data
和plot_3d
出于测试目的:import numpy as np
def get_data():
np.random.seed(100)
N = 200
maxval = 20
x = np.random.random(N) * maxval
y = np.random.random(N) * maxval
z = x ** 2 + np.sqrt(y) * y - y ** 3 + np.random.random(N) + 18 * y ** 2 * 2
w = x ** 2 - np.log(y + (x * y) ** 2)
return x, y, z, w
def plot_3d(x, y, z, w=None, show=True):
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import axes3d
fig = plt.figure(figsize=(10, 6))
ax = axes3d.Axes3D(fig)
ax.scatter3D(x, y, z, c=w if not w is None else "b")
plt.show()
关于python - python中的3D外推法(基本上,scipy.griddata扩展为外推法),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/11214118/