python - 为什么'rmagic'％R在读取文件时引起错误，而%% R却没有？

使用rmagic读取a particular file（而不是其他）时，在%R和%%R之间出现不一致的行为：为什么

%%R

usda = read.csv("USDA.csv")

工作，而

%R usda = read.csv("USDA.csv")

失败于

---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-64-01ec3b4742c8> in <module>()
----> 1 get_ipython().magic(u'R usda = read.csv("USDA.csv")')

...

/Library/Python/2.7/site-packages/numpy/core/numeric.pyc in asarray(a, dtype, order)
    458
    459     """
--> 460     return array(a, dtype, copy=False, order=order)
    461
    462 def asanyarray(a, dtype=None, order=None):

TypeError: __float__ returned non-float (type rpy2.rinterface.NAIntegerType)

同样，这仅在the linked file上发生，而在我尝试过的其他任何情况下都不会发生。

最佳答案

这是我以前见过的缺失的价值处理问题。每当您缺少值时，都应该发生这种情况。我不确定是否应该将其视为错误。但是%R -n usda = read.csv('USDA.csv')禁止使用numpy返回（一个array -n）将避免此问题。

还应注意，如果在%Rpull usda之后使用%R -n usda = read.csv('USDA.csv')，则应类似地获得相同的异常。

如果您想在这种情况下在python和R之间来回传输数据，我认为先使用pandas然后再使用convert_to_r_dataframe和convert_robject读取数据。

关于python - 为什么'rmagic'％R在读取文件时引起错误，而%% R却没有？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/22749489/