我在R. Stack Overflow has a lot of them中找到了许多有关如何绘制维恩图的资源。但是,我仍然无法按照自己的方式绘制图表。以以下代码为例:
library("VennDiagram")
A <- 1:4
B <- 3:6
d <- list(A, B)
vp <- venn.diagram(d, fill = c("white", "white"), alpha = 1, filename = NULL,
category.names=c("A", "B"))
grid.draw(vp)
我希望集合之间的交点为红色。但是,如果我将任何白色更改为红色,则会得到以下信息:
vp_red <- venn.diagram(d, fill = c("red", "white"), alpha = 1, filename = NULL,
category.names=c("A", "B"))
grid.draw(vp_red)
那不是我想要的。我只希望路口是红色的。如果我更改Alpha,这就是我得到的:
vp_alpha <- venn.diagram(d, fill = c("red", "white"), alpha = 0.5, filename = NULL,
category.names=c("A", "B"))
grid.draw(vp_alpha)
现在我的路口有粉红色。这也不是我想要的。我想要的是这样的image from Wikipedia:
我怎样才能做到这一点?也许
VennDiagram
软件包不能做到这一点,而我还需要其他软件包,但是我一直在尝试不同的方法来做到这一点,而我却找不到解决方案。 最佳答案
我将展示两种不同的可能性。在第一个示例中,polyclip::polyclip
用于获取交集。在第二个示例中,圆被转换为sp::SpatialPolygons
,我们使用rgeos::gIntersection
获得了交点。然后,我们重新绘制圆圈并填充相交区域。
使用venn.diagram
时得到的对象是
因此,在两种情况下,我们都可以从“vp”中获取相关数据。首先,检查str
的结构并列出对象的grobs
:
str(vp)
grid.ls()
# GRID.polygon.234
# GRID.polygon.235
# GRID.polygon.236 <~~ these are the empty circles
# GRID.polygon.237 <~~ $ col : chr "black"; $ fill: chr "transparent"
# GRID.text.238 <~~ labels
# GRID.text.239
# GRID.text.240
# GRID.text.241
# GRID.text.242
1.
polyclip
抓取x和y值,并将其以polyclip
所需的格式放置:A <- list(list(x = as.vector(vp[[3]][[1]]), y = as.vector(vp[[3]][[2]])))
B <- list(list(x = as.vector(vp[[4]][[1]]), y = as.vector(vp[[4]][[2]])))
查找交集:library(polyclip)
AintB <- polyclip(A, B)
抓斗标签:ix <- sapply(vp, function(x) grepl("text", x$name, fixed = TRUE))
labs <- do.call(rbind.data.frame, lapply(vp[ix], `[`, c("x", "y", "label")))
绘制它!plot(c(0, 1), c(0, 1), type = "n", axes = FALSE, xlab = "", ylab = "")
polygon(A[[1]])
polygon(B[[1]])
polygon(AintB[[1]], col = "red")
text(x = labs$x, y = labs$y, labels = labs$label)
2.
SpatialPolygons
和gIntersection
捕获圆的坐标:# grab x- and y-values from first circle
x1 <- vp[[3]][["x"]]
y1 <- vp[[3]][["y"]]
# grab x- and y-values from second circle
x2 <- vp[[4]][["x"]]
y2 <- vp[[4]][["y"]]
将点转换为SpatialPolygons
并找到它们的交集:library(sp)
library(rgeos)
p1 <- SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(cbind(x1, y1))), ID = 1)))
p2 <- SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(cbind(x2, y2))), ID = 2)))
ip <- gIntersection(p1, p2)
绘制它!# plot circles
plot(p1, xlim = range(c(x1, x2)), ylim = range(c(y1, y2)))
plot(p2, add = TRUE)
# plot intersection
plot(ip, add = TRUE, col = "red")
# add labels (see above)
text(x = labs$x, y = labs$y, labels = labs$label)
我很确定您可以使用
grobs
或grid
包中的剪切函数直接在gridSVG
上工作。关于r - 如何在维恩图中定义相交的颜色?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/43963293/