嗨，我正在使用基因表达矩阵，碎片计数来计算差异表达的基因。我想知道如何删除值为0的行。然后，我的数据集将变得紧凑，并且对于我使用此矩阵进行的下游分析，将得到较少的虚假结果。
输入项
gene ZPT.1 ZPT.0 ZPT.2 ZPT.3 PDGT.1 PDGT.0
XLOC_000001 3516 626 1277 770 4309 9030
XLOC_000002 342 82 185 72 835 1095
XLOC_000003 2000 361 867 438 454 687
XLOC_000004 143 30 67 37 90 236
XLOC_000005 0 0 0 0 0 0
XLOC_000006 0 0 0 0 0 0
XLOC_000007 0 0 0 0 1 3
XLOC_000008 0 0 0 0 0 0
XLOC_000009 0 0 0 0 0 0
XLOC_000010 7 1 5 3 0 1
XLOC_000011 63 10 19 15 92 228
所需的输出
gene ZPT.1 ZPT.0 ZPT.2 ZPT.3 PDGT.1 PDGT.0
XLOC_000001 3516 626 1277 770 4309 9030
XLOC_000002 342 82 185 72 835 1095
XLOC_000003 2000 361 867 438 454 687
XLOC_000004 143 30 67 37 90 236
XLOC_000007 0 0 0 0 1 3
XLOC_000010 7 1 5 3 0 1
XLOC_000011 63 10 19 15 92 228
到目前为止，我只想删除所有碎片计数列均为0的那些行，如果在任何行中某些值均为0而另一些值都不为零，那么我想保持该行不变，就像您在上面的示例中看到的那样。
请让我知道该怎么做。
最佳答案
df[apply(df[,-1], 1, function(x) !all(x==0)),]