python - Open CV (Python) - 脑肿瘤的异常形状 Blob 检测

我正在尝试通过 Open CV 中的 Blob 检测来识别脑肿瘤，但到目前为止，Open CV 只能检测脑 MRI 中的小圆圈，而从未检测到肿瘤本身。

这是代码:

import cv2
from cv2 import SimpleBlobDetector_create, SimpleBlobDetector_Params
import numpy as np

# Read image
def blobber(filename):
    im = cv2.imread(filename, cv2.IMREAD_GRAYSCALE)

    # Set up the detector with default parameters.
    detector = cv2.SimpleBlobDetector_create()

    params = cv2.SimpleBlobDetector_Params()

    # Filter by Area.
    params.filterByArea = True
    params.minArea = 50

    # Filter by Circularity
    params.filterByCircularity = True
    params.minCircularity = 0

    # Filter by Convexity
    params.filterByConvexity = True
    params.minConvexity = 0.1

    # Create a detector with the parameters
    ver = (cv2.__version__).split('.')
    if int(ver[0]) < 3 :
        detector = cv2.SimpleBlobDetector(params)
    else :
        detector = cv2.SimpleBlobDetector_create(params)

    # Detect blobs.
    keypoints = detector.detect(im)

    # Draw detected blobs as red circles.
    # cv2.DRAW_MATCHES_FLAGS_DRAW_RICH_KEYPOINTS ensures the size of the circle corresponds to the size of blob
    im_with_keypoints = cv2.drawKeypoints(im,keypoints,np.array([]),(0,0,255),cv2.DRAW_MATCHES_FLAGS_DRAW_RICH_KEYPOINTS)

    # Show keypoints
    cv2.imshow("Keypoints", im_with_keypoints)
    cv2.waitKey(0)

这是当我向程序提供黑白对比大脑的图像时发生的情况(我对比了大脑，因此肿瘤会显示为黑色，而大脑的其余部分将大部分为白色):

无论如何，肿瘤不是一个完美的圆形，但它显然是大脑中最大的“ Blob ”。 Open CV 拿不出来，我怀疑是因为它的 shell 是黑色的，内核是白色的。



只有当我选择一个更容易区分的肿瘤，没有大的白色内核时，它才能把肿瘤捡起来。


有什么建议吗？我需要能够从原始图片中剥离这些 Blob (一旦它们准确工作)，并使用它们的关键点从每个切片中的 2D 肿瘤重建大脑中的整个 3D 肿瘤。我离那一步有点远，但是这个 blob 检测器问题是 2D 和 3D 之间的关键链接。感谢所有帮助!

最佳答案

可能最大的 Blob 是头骨本身。
如果你分散最大的 Blob ，并保持下一件大事，请使用轮廓作为局外人