r - 在R中使用％dopar％代替％do％时出错(软件包doParallel)

我提出了一个奇怪的错误。
假设我在名为data的列表中有10个xts对象。我现在使用搜索每三个组合

   data_names <- names(data)
   combs <- combn(data_names, 3)

我的基本目标是在这1080个三元组上进行PCA。
为了加快速度，请使用 doParallel 软件包。因此，这里的代码段缩短到了发生错误的地步:

list <- foreach(i=1:ncol(combs)) %dopar% {
    tmp_triple <- combs[,i]

    p1<-data[tmp_triple[[1]]][[1]]
    p2<-data[tmp_triple[[2]]][[1]]
    p3<-data[tmp_triple[[3]]][[1]]

    data.merge <- merge(p1,p2,p3,all=FALSE)
}

在这里，合并功能似乎是问题所在。错误是

任务1失败-“无法将类'c(“xts”，“zoo”)'强制转换为data.frame”

但是，将％dopar％更改为常规串行％do％时，一切正常。

到现在为止，我仍无法找到解决该问题的任何方法，甚至不确定要寻找什么。

最佳答案

一个更好的解决方案是使用foreach()函数的 .packages 参数，而不是在函数中显式加载库:

list <- foreach(i=1:ncol(combs),.packages=c("xts","zoo")) %dopar% {
    tmp_triple <- combs[,i]

    p1<-data[tmp_triple[[1]]][[1]]
    p2<-data[tmp_triple[[2]]][[1]]
    p3<-data[tmp_triple[[3]]][[1]]

    data.merge <- merge(p1,p2,p3,all=FALSE)
}

关于r - 在R中使用％dopar％代替％do％时出错(软件包doParallel)，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/17157211/