r - R中的相关性聚类

我想使用correlation clustering，我认为R是一个不错的起点。

我可以将数据作为一组较大的稀疏向量或带有预先计算的相异矩阵的表呈现给R。

我的问题是:

是否存在现有的R函数将其转换为使用hierarchical cluster的agnes的correlation clustering？

我将必须手动实现(非常简单的)correlation clustering函数，如果是的话，我如何使其与agnes一起很好地发挥作用？

最佳答案

我承认对此主题知之甚少，但只是为您指明了一个方向:

您是否看过集群软件包？它有很好的文档。特别是，请查看帮助(agnes)以获取一些建议。 Martin Maechler(R核心团队的成员)创建了该程序包，并且之前参与过Stack Overflow的讨论，因此希望他会在此处提供答案。

hclust()函数是stats包的一部分。实际上，我相信有合并hclust()和agnes()的计划。

您可能还会找到this page from the Bioconductor project helpful。

否则，您可能会有些运气，无法在CRAN的Clustering，Natural Language Processing或Machine Learning View 上查看其他软件包。

关于r - R中的相关性聚类，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/1468962/