我目前正在Linux集群上的R中运行一些物种分布建模和丰富度映射。为了运行分析,我需要安装rgdal,以便建模包中的栅格函数正确运行。我已经安装了proj4和gdal。但是,当我尝试安装rgdal时,出现错误消息:

checking for gdal-config... no
no

configure: error: gdal-config not found or not executable.
ERROR: configuration failed for package 'rgdal'

这是我用来安装rgdal软件包的命令:
install.packages("rgdal", configure.args=c("--with-proj-include=/home/nikhail1/bin/proj-4.9.2/bin", "--with-proj-lib=/home/nikhail1/bin/proj-4.9,2/lib"))

但是,尽管出现gdal-config错误,但gdal似乎已安装到我的本地系统上(二进制和库文件夹位于我安装它们的地址中)。在gdal安装过程中,我也没有看到任何错误消息。为什么会发生此错误?如何让R识别已安装此依赖项,或者确实存在问题,如何识别它?我在网上找到的大多数解决方案都是针对我未使用的Debian和Ubuntu系统的。我无权使用sudo apt-get或yum命令。我只安装了proj 4.9.2,我是否缺少对gdal的依赖?

我是Linux系统以及rgdal和gdal软件包的新手。

非常感谢您的协助

亲切的问候,

尼克海尔

最佳答案

在Linux上的R中安装RGDAL

在R中运行以下命令:

# install package from CRAN
# but specify the library director
# the download method
# and the configuration arguments
# to allow for source installs
install.packages( pkgs = "rgdal"
                    , lib = "./R_Packages"
                    , method = "curl"
                    , configure.args = c(
                                   "--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config"
                                   , "--with-proj-include=/p/home/bin/proj4/include"
                                   , "--with-proj-lib=/p/home/bin/proj4/lib"
                                     )
      )

答案来自交叉引用Errors installing rgdal on LINUX system?Trouble installing rgdal

关于r - 配置rgdal “gdal-config”中的错误,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/48668535/

10-12 17:49