我目前正在进行MD模拟。它将分子位置存储在向量中。对于每个时间步长，该矢量都会存储起来，以显示在第二个矢量中，从而
std::vector<std::vector<molecule> > data;
data的大小为time steps*<number of molecules>*sizeof(molecule)，其中sizeof（分子）为（已减小）3*sizeof(double)作为位置向量。对于大量的时间步长和分子数量，我仍然遇到内存问题。因此，还有其他减少数据量的可能性吗？我当前的工作流程是，我首先计算所有分子，将它们存储起来，然后通过使用每个步骤的每个分子的数据来渲染它们，渲染使用Irrlicht完成。 （也许以后用搅拌器）。
最佳答案
如果轨迹是平滑的，则可以考虑仅每第N步存储一次并通过插值恢复中间位置来压缩数据。
如果时间步长较小，则可以执行线性插值。三次样条可以提供最高质量。无论如何，样条系数的计算是一个全局运算，您只能在最后执行，并且需要额外的存储（！），并且您可能更喜欢可在四个连续位置本地构建的Cardinal样条。
关于c++ - 用于分子计算的内存保存系统，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/40149260/