我正在使用mkl
cblas_dgemm
,当前将其与CblasRowMajor
,CblasNoTrans
,CblasNotrans
一起用于我的矩阵。
我知道c
是行主要语言,而dgemm
是列主要算法。我有兴趣知道,如果我针对cblas_dgemm
进行链接,切换矩阵的顺序是否会对mkl
算法产生任何影响。 mkl
是否足够聪明,可以在幕后做一些事情来优化矩阵乘法呢?如果不是,用mkl
执行矩阵乘法的最佳方法是什么?
最佳答案
TL; DR:简而言之,无关紧要,无论是使用MKL(和其他BLAS实现)使用行优先还是列优先排序来执行矩阵矩阵乘法。
DGEMM是而不是的主要列算法,它是用于计算具有通用矩阵的矩阵-矩阵乘积的BLAS接口(interface)。 DGEMM(以及大多数BLAS)的常见引用实现是Netlib's,它是用Fortran编写的。它假定列为主要顺序的唯一原因是因为Fortran是列为主要顺序的语言。 DGEMM(以及相应的BLAS 3级功能)是而不是,专门用于列主数据。
DGEMM计算什么?
基本数学中的DGEMM执行2D matrix-matrix multiplication。用于将2D矩阵相乘的标准算法要求您沿其行遍历一个矩阵,并沿其列遍历另一个矩阵。要执行矩阵矩阵乘法, AB = C ,我们将 A 的行乘以 B 的列以产生 C 。因此,输入矩阵的顺序无关紧要,因为一个矩阵必须沿其行遍历,而另一个矩阵必须沿其列遍历。
使用MKL研究行主和列主DGEMM计算
英特尔MKL足够聪明,可以在后台充分利用它,并为行主数据和列主数据提供完全相同的性能。
cblas_dgemm(CblasRowMajor, CblasNoTrans, CblasNoTrans, ...);
和
cblas_dgemm(CblasColMajor, CblasNoTrans, CblasNoTrans, ...);
将以类似的性能执行。我们可以用一个相对简单的程序来测试
#include <float.h>
#include <mkl.h>
#include <omp.h>
#include <stdio.h>
void init_matrix(double *A, int n, int m, double d);
void test_dgemm(CBLAS_LAYOUT Layout, double *A, double *B, double *C, const MKL_INT m, const MKL_INT n, const MKL_INT k, int nSamples, double *timing);
void print_summary(const MKL_INT m, const MKL_INT n, const MKL_INT k, const int nSamples, const double *timing);
int main(int argc, char **argv) {
MKL_INT n, k, m;
double *a, *b, *c;
double *timing;
int nSamples = 1;
if (argc != 5){
fprintf(stderr, "Error: Wrong number of arguments!\n");
fprintf(stderr, "usage: %s mMatrix nMatrix kMatrix NSamples\n", argv[0]);
return -1;
}
m = atoi(argv[1]);
n = atoi(argv[2]);
k = atoi(argv[3]);
nSamples = atoi(argv[4]);
timing = malloc(nSamples * sizeof *timing);
a = mkl_malloc(m*k * sizeof *a, 64);
b = mkl_malloc(k*n * sizeof *a, 64);
c = mkl_calloc(m*n, sizeof *a, 64);
/** ROW-MAJOR ORDERING **/
test_dgemm(CblasRowMajor, a, b, c, m, n, k, nSamples, timing);
/** COLUMN-MAJOR ORDERING **/
test_dgemm(CblasColMajor, a, b, c, m, n, k, nSamples, timing);
mkl_free(a);
mkl_free(b);
mkl_free(c);
free(timing);
}
void init_matrix(double *A, int n, int m, double d) {
int i, j;
#pragma omp for schedule (static) private(i,j)
for (i = 0; i < n; ++i) {
for (j = 0; j < m; ++j) {
A[j + i*n] = d * (double) ((i - j) / n);
}
}
}
void test_dgemm(CBLAS_LAYOUT Layout, double *A, double *B, double *C, const MKL_INT m, const MKL_INT n, const MKL_INT k, int nSamples, double *timing) {
int i;
MKL_INT lda = m, ldb = k, ldc = m;
double alpha = 1.0, beta = 0.0;
if (CblasRowMajor == Layout) {
printf("\n*****ROW-MAJOR ORDERING*****\n\n");
} else if (CblasColMajor == Layout) {
printf("\n*****COLUMN-MAJOR ORDERING*****\n\n");
}
init_matrix(A, m, k, 0.5);
init_matrix(B, k, n, 0.75);
init_matrix(C, m, n, 0);
// First call performs any buffer/thread initialisation
cblas_dgemm(Layout, CblasNoTrans, CblasNoTrans, m, n, k, alpha, A, lda, B, ldb, beta, C, ldc);
double tmin = DBL_MAX, tmax = 0.0;
for (i = 0; i < nSamples; ++i) {
init_matrix(A, m, k, 0.5);
init_matrix(B, k, n, 0.75);
init_matrix(C, m, n, 0);
timing[i] = dsecnd();
cblas_dgemm(Layout, CblasNoTrans, CblasNoTrans, m, n, k, alpha, A, lda, B, ldb, beta, C, ldc);
timing[i] = dsecnd() - timing[i];
if (tmin > timing[i]) tmin = timing[i];
else if (tmax < timing[i]) tmax = timing[i];
}
print_summary(m, n, k, nSamples, timing);
}
void print_summary(const MKL_INT m, const MKL_INT n, const MKL_INT k, const int nSamples, const double *timing) {
int i;
double tavg = 0.0;
for(i = 0; i < nSamples; i++) {
tavg += timing[i];
}
tavg /= nSamples;
printf("#Loop | Sizes m n k | Time (s)\n");
for(i = 0; i < nSamples; i++) {
printf("%4d %12d %3d %3d %6.4f\n", i + 1 , m, n, k, timing[i]);
}
printf("Summary:\n");
printf("Sizes m n k | Avg. Time (s)\n");
printf(" %8d %3d %3d %12.8f\n", m, n, k, tavg);
}
在我的系统上会产生
$ ./benchmark_dgemm 1000 1000 1000 5
*****ROW-MAJOR ORDERING*****
#Loop | Sizes m n k | Time (s)
1 1000 1000 1000 0.0589
2 1000 1000 1000 0.0596
3 1000 1000 1000 0.0603
4 1000 1000 1000 0.0626
5 1000 1000 1000 0.0584
Summary:
Sizes m n k | Avg. Time (s)
1000 1000 1000 0.05995692
*****COLUMN-MAJOR ORDERING*****
#Loop | Sizes m n k | Time (s)
1 1000 1000 1000 0.0597
2 1000 1000 1000 0.0610
3 1000 1000 1000 0.0581
4 1000 1000 1000 0.0594
5 1000 1000 1000 0.0596
Summary:
Sizes m n k | Avg. Time (s)
1000 1000 1000 0.05955171
从中可以看到,列优先排序时间和行优先排序时间之间的差异很小。列主要的为0.0595秒,列主要的为0.0599 秒。再次执行此操作可能会产生以下结果,其中主要行计算的速度更快了 0.00003 秒。
$ ./benchmark_dgemm 1000 1000 1000 5
*****ROW-MAJOR ORDERING*****
#Loop | Sizes m n k | Time (s)
1 1000 1000 1000 0.0674
2 1000 1000 1000 0.0598
3 1000 1000 1000 0.0595
4 1000 1000 1000 0.0587
5 1000 1000 1000 0.0584
Summary:
Sizes m n k | Avg. Time (s)
1000 1000 1000 0.06075310
*****COLUMN-MAJOR ORDERING*****
#Loop | Sizes m n k | Time (s)
1 1000 1000 1000 0.0634
2 1000 1000 1000 0.0596
3 1000 1000 1000 0.0582
4 1000 1000 1000 0.0582
5 1000 1000 1000 0.0645
Summary:
Sizes m n k | Avg. Time (s)
1000 1000 1000 0.06078266