我正在尝试使用glmnet软件包构建模型，但是在运行以下行时出现以下错误:
#library('glmnet')
x = model.matrix(response ~ ., data = acgh_frame[,c(3:ncol(acgh_frame))])
Error: protect(): protection stack overflow
我知道这是由于我在数据框中存在大量变量(26k +)所致。当我使用较少的变量时，错误不会显示。我知道如何在命令行R中解决此问题，但是我需要留在R Studio中，因此我想从R Studio中对其进行修复。
那么，我该怎么做呢？
最佳答案
@ Ansjovis86
您可以将ppsize指定为Rstudio的命令行参数
rstudio.exe --max-ppsize=5000000
您也可以通过
.Rprofile或在运行时通过使用options(expressions = 5e5)命令来设置表达式选项。> options(expressions = 5e5)
>?options
...
表达式:
对将要计算的嵌套表达式的数量设置一个限制。有效值为25 ... 500000，默认值为5000。如果增加该值，则可能还希望使用更大的保护堆栈来启动R；否则，可能会增加R。请参阅内存中的--max-ppsize。还要注意，您可能会由于C堆栈的溢出而导致段错误，并且在可能会希望增加该值的OS上。一旦达到限制，就会引发错误。可以通过调用
Cstack_info找到当前正在评估的数字。Cstack_info() - to determine current setting.s