这段代码:
alTrack <- Gviz::AlignmentsTrack(
system.file(package = "Gviz", "extdata", "gapped.bam"),
isPaired = TRUE)
Gviz::plotTracks(
alTrack,
from = 3048500,
to = 3049000,
chromosome = "chr12")
产生此图:
使用Gviz包。我的问题是图片底部始终出现空白区域。如何删除该地块/作物的特定区域,仅保留所需区域?如果我可以使用R函数删除生成的图的较低15%,那就太好了。
我不想出现的特定区域:
最佳答案
max.height参数将执行此操作。
在这里已经回答:
https://support.bioconductor.org/p/81044/