r - R 中 system() 和 system2() 的区别？在变量中捕获文件名

在 R 中，我想列出目录中的文件，并捕获输出，但是 R 有两个对系统的调用:system() 和 system2()。我很好奇有什么区别，如果有的话，更重要的是如何使用它们。我找到了一些页面，包括 here 和 here ，但我想在这里放一些例子，以及我在使用 system2() 时遇到的错误，包括:

最佳答案

在研究之前，我的第一次尝试都是在 system() 中完成的，因为我不知道 system2() 。为了可移植性，我决定在 system2() 中重做我的方法(我在 Linux 系统上工作)。这让我发现了一些差异。

首先，system() 解决方案列出文件并将输出保存在变量中:

gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system(paste("ls", gseaDirectory, sep=" "), intern=T)

这将我的主目录所在的字符串“/home”存储到变量 gseaDirectory 中。然后我能够将命令 ls 、一个空格、 sep=" " 和我的目录变量 gseaDirectory 粘贴到一个 linux 命令中，以列出所选目录中的所有文件:

ls /home

然后将文件列表保存在变量 "filenames"中，并添加了 system() 参数 intern=T 。

这在 system2() 中不起作用，只会返回错误:



我们相同的方法略有变化，等效的 system2() 命令是:

gseaDirectory<-"/home"
filenames<-system2('ls',  paste(gseaDirectory, sep=" "), stdout = TRUE)

system2 中的第一项是命令，然后是目标文件，然后是 stdout=T，它告诉 R 我们要将输出存储到变量中，否则我们的命令的结果将被打印而不是保存。

希望这可以帮助某人!

关于r - R 中 system() 和 system2() 的区别？在变量中捕获文件名，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/48605776/