我有一个名为df的熊猫数据框,如下所示:

0   2J-AAB1 AA  AA  CC  CC  AA  AA  CC  AA  CC
1   2J-AAB4 AA  TA  TC  TC  GA  AA  CC  AA  CC
2   2J-AAB6 AA  TA  CC  CC  AA  AA  CC  AA  CC
3   2J-AAB8 AA  TT  TT  TT  GG  AA  TC  CC  CC
4   2J-AAB9 AA  TT  TT  TT  GG  AA  TC  CC  CC
5   2J-AABA AA  AA  CC  CC  GA  AG  CC  AA  CG
6   2J-AABE AA  TT  TT  TT  GG  AA  TC  CA  CC
7   2J-AABF AA  AA  CC  CC  AA  AA  CC  AA  CC
8   2J-AABH AA  TT  TT  TT  GG  AA  CC  AA  CC
9   2J-AABI AA  AA  CC  CC  AA  AA  CC  AA  CG


我想将“ AA,AT,CC”等列全部分为两列,并获取新的数据框,例如:

0   2J-AAB1 A   A   A   A   C   C   C   C   A   A   A   A   C   C   A   A   C   C
1   2J-AAB4 A   A   T   A   T   C   T   C   G   A   A   A   C   C   A   A   C   C
2   2J-AAB6 A   A   T   A   C   C   C   C   A   A   A   A   C   C   A   A   C   C
3   2J-AAB8 A   A   T   T   T   T   T   T   G   G   A   A   T   C   C   C   C   C
4   2J-AAB9 A   A   T   T   T   T   T   T   G   G   A   A   T   C   C   C   C   C
5   2J-AABA A   A   A   A   C   C   C   C   G   A   A   G   C   C   A   A   C   G
6   2J-AABE A   A   T   T   T   T   T   T   G   G   A   A   T   C   C   A   C   C
7   2J-AABF A   A   A   A   C   C   C   C   A   A   A   A   C   C   A   A   C   C
8   2J-AABH A   A   T   T   T   T   T   T   G   G   A   A   C   C   A   A   C   C
9   2J-AABI A   A   A   A   C   C   C   C   A   A   A   A   C   C   A   A   C   G


有pythonic的方法可以做到吗?任何建议表示赞赏..在此先感谢

最佳答案

尝试这个:

In [60]: x = df.set_index(1).stack().str.extractall('(.)').unstack([-2, -1]).reset_index()

In [61]: x.columns = np.arange(len(x.columns))

In [62]: x
Out[62]:
        0  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10 11 12 13 14 15 16 17 18
0  2J-AAB1  A  A  A  A  C  C  C  C  A  A  A  A  C  C  A  A  C  C
1  2J-AAB4  A  A  T  A  T  C  T  C  G  A  A  A  C  C  A  A  C  C
2  2J-AAB6  A  A  T  A  C  C  C  C  A  A  A  A  C  C  A  A  C  C
3  2J-AAB8  A  A  T  T  T  T  T  T  G  G  A  A  T  C  C  C  C  C
4  2J-AAB9  A  A  T  T  T  T  T  T  G  G  A  A  T  C  C  C  C  C
5  2J-AABA  A  A  A  A  C  C  C  C  G  A  A  G  C  C  A  A  C  G
6  2J-AABE  A  A  T  T  T  T  T  T  G  G  A  A  T  C  C  A  C  C
7  2J-AABF  A  A  A  A  C  C  C  C  A  A  A  A  C  C  A  A  C  C
8  2J-AABH  A  A  T  T  T  T  T  T  G  G  A  A  C  C  A  A  C  C
9  2J-AABI  A  A  A  A  C  C  C  C  A  A  A  A  C  C  A  A  C  G

关于python - Pandas Dataframe:将多列分为两列,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/43716131/

10-12 21:08