我有以下数据集
> head(names$SAMPLE_ID)
[1] "Bacteria|Proteobacteria|Gammaproteobacteria|Pseudomonadales|Moraxellaceae|Acinetobacter|"
[2] "Bacteria|Firmicutes|Bacilli|Bacillales|Bacillaceae|Bacillus|"
[3] "Bacteria|Proteobacteria|Gammaproteobacteria|Pasteurellales|Pasteurellaceae|Haemophilus|"
[4] "Bacteria|Firmicutes|Bacilli|Lactobacillales|Streptococcaceae|Streptococcus|"
[5] "Bacteria|Firmicutes|Bacilli|Lactobacillales|Streptococcaceae|Streptococcus|"
[6] "Bacteria|Firmicutes|Bacilli|Lactobacillales|Streptococcaceae|Streptococcus|"
我想提取
||
之间的最后一个单词作为新变量,即Acinetobacter
Bacillus
Haemophilus
我尝试使用
library(stringr)
names$sample2 <- str_match(names$SAMPLE_ID, "|.*?|")
最佳答案
我们可以用
library(stringi)
stri_extract_last_regex(v1, '\\w+')
#[1] "Acinetobacter"
数据
v1 <- "Bacteria|Proteobacteria|Gammaproteobacteria|Pseudomonadales|Moraxellaceae|Acinetobacter|"