r - 如何在R中将树转换为树状图？

如何将树(这是Java程序的输出)转换为R中的树状图？

目前，我正在使用here的建议将树转换为Newick格式。然后，我使用R中的ape包来读取Newick格式的树:

library("ape")
cPhylo <- read.tree(file = "gc.tree")

最后，我在R中使用as.hclust将树转换为树状图:

dendrogram <- as.hclust(gcPhylo)

但是，树状图需要分支长度。尽管我插入了分支长度，但我收到一个错误，指出树不是超尺寸的:



我猜我在插入分支长度时做错了什么。

我还有其他方法可以遵循吗？或者在将树转换为Newick格式时如何插入分支长度？相等的分支长度会很好。

最佳答案

这是一个老问题，但是到目前为止，答案还不够。由于我遇到了同样的问题，而我的googlefoo在寻找答案时遇到了问题，因此您可以执行以下操作:

library("ape")
cPhylo <- read.tree(file = "gc.tree")
dendrogram <- chronos(cPhylo)

关于r - 如何在R中将树转换为树状图？，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/7445684/