在下面的代码中,我构造了一个变量$probe1,然后我想将它传递给一个bash脚本。在下面的玩具示例中,输出为空,即$probe1在os.system调用中无法识别bash shell脚本。需要做什么?
for line1 in datfile:
datmat=datmat+[line1.rstrip('\n').split('\t')]
probe=datmat[i][0]
snp1=datmat[i][2]
probe1='permprobes'+probe+'pheno.pphe'
os.system('echo $probe1')
最佳答案
似乎这就是你要做的:
In [2]: os.environ['probe1'] = 'hello'
In [3]: os.system('echo $probe1')
hello
但我不知道你为什么要这么做…