我正在使用Python编写脚本来处理博士学位中的某些化学结构。我想为python安装openbabel库。我已尽力而为,但无法在Windows上安装它。我早些时候发布了一个关于在Windows上How do I install openbabel for Python 3.6 in Windows 10?上安装它的问题,但是找不到解决方案。该解决方案安装了该库,但无法运行,并且无法连接到SWIG。
不,我试图将其安装在过去5个小时为Mac的办公室计算机上,但我不知道发生了什么。
我试图从Opnbabel的源代码安装它,并将其与python3链接,但是这引起了问题。
如果我使用以下命令:

cmake ../ -DPYTHON_BINDINGS=ON -DRUN_SWIG=ON

它成功地将其链接到我不想要的Python 2.7。当我尝试以下选项时,它显示以下错误:

cmake ../ -DPYTHON_EXECUTABLE=/usr/bin/python3 -DPYTHON_BINDINGS=ON -DRUN_SWIG=ON

要么

cmake ../ -DRUN_SWIG=ON -DPYTHON_EXECUTABLE=/usr/bin/python3 -DPYTHON_INCLUDE_DIR=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/include/python3.5m -DPYTHON_LIBRARY=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/libpython3.5m.dylib -DPYTHON_BINDINGS=ON

在大量成功输出之后,最终会出现以下错误:

-- Found PythonInterp: /usr/bin/python3.6 (found version "1.4")
-- Found SWIG: /usr/local/bin/swig (found version "3.0.12")
-- Found SWIG: /usr/local/bin/swig (found suitable version "3.0.12", minimum required is "2.0")
-- Found PythonLibs: /usr/local/Cellar/python3/3.6.0/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/libpython3.6m.dylib (found version "3.6.0")
-- Python bindings will be compiled
CMake Error at scripts/CMakeLists.txt:120 (install):
install TARGETS given no LIBRARY DESTINATION for module target
"bindings_python".
CMake Error at scripts/CMakeLists.txt:123 (install):
install FILES given no DESTINATION!
CMake Error at scripts/CMakeLists.txt:126 (install):
install FILES given no DESTINATION!
-- Configuring incomplete, errors occurred!
See also "/usr/local/Cellar/obabel/openbabel-master/ali/CMakeFiles/CMakeOutput.log".
See also "/usr/local/Cellar/obabel/openbabel-master/ali/CMakeFiles/CMakeError.log".


我不确定为什么它将Python检测为v1.4 -- Found PythonInterp: /usr/bin/python3.6 (found version "1.4")而不是找到v.3.5。
我也尝试了python 3.6的所有过程,但发生相同的错误。我还使用从github获得的openbabel,据说在下面的文章中正在使用这些命令:http://forums.openbabel.org/OpenBabel-for-Python-3-td4659432.html
但是它也不是很好。
请帮助我,因为我需要此模块来进行研究。
谢谢

最佳答案

我找到了解决方案。这是详细的解决方案:


从原始来源(https://github.com/openbabel/openbabel)下载Open Babel
解压缩并放入CD(openbabel-master)
使目录“ build”并进入cd。
运行以下命令:

cmake ../ -DPYTHON_EXECUTABLE=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/bin/python3 -DPYTHON_BINDINGS=ON -DRUN_SWIG=ON

在上面的命令中,“-DPYTHON_EXECUTABLE”开关告诉它找到Python3解释器的路径。您可以在终端上通过which python3进行检查。
make
make install


全做完了! :)

关于python - 如何在macOS Sierra 10.12.3上安装适用于Python 3.6的openbabel,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/42195236/

10-11 10:23