Drawing a huge graph with networkX and matplotlib

我基本上是在重新提出链接的问题。我想我可以更好地解释这个问题。在大图上调用 mathplotlib.show() 时,默认值是缩小的聚类输出。我想要的最终状态是使用 mathplotlib.savefig() 来保存绘图以供在报告中使用。但是,savefig() 输出太缩小了,太笼统了。更改图像大小或 dpi 不能解决此问题。只会使缩小的图像更大。有没有办法在不使用 UI 的情况下放大图形并保存它?使用 UI,我可以放大、展开节点并以相关节点为中心,但我不知道如何自动执行此操作。

相关代码:

    nx.draw(G,pos,node_color=colorvalues, with_labels = False,node_size=values)
    fig.set_size_inches(11,8.5)
    if show ==0:
        plt.show()
    if show ==1:
        plt.savefig(name+" coremem.png",bbox_inches=0,orientation='landscape',pad_inches=0.1)

最佳答案

您可以使用 ax.set_xlimax.set_ylim 来设置绘图的 xy 范围。例如,

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

filename = '/tmp/graph.png'
G = nx.complete_graph(10)
pos = nx.spring_layout(G)
xy = np.row_stack([point for key, point in pos.iteritems()])
x, y = np.median(xy, axis=0)
fig, ax = plt.subplots()
nx.draw(G, pos, with_labels=False, node_size=1)
ax.set_xlim(x-0.25, x+0.25)
ax.set_ylim(y-0.25, y+0.25)
plt.savefig(filename, bbox_inches=0, orientation='landscape', pad_inches=0.1)



要找出原始限制(在调用 ax.set_xlimax.set_ylim 之前),请使用
>>> ax.get_xlim()
(-0.20000000000000001, 1.2000000000000002)

ax.get_ylim()
(-0.20000000000000001, 1.2000000000000002)

关于python - 放大图上的 Matplotlib savefig(),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/17455959/

10-12 21:49