我正在使用roxygen2开发一个程序包,其中包括许多基于lattice的可视化文件。这些很好,但对于使用该软件包不是必需的,因此latticeSuggests:文件的DESCRIPTION部分而不是Depends:部分中列出。

但是,我还没有弄清楚如何应用户的要求以同时传递latticeroxygenize()的方式加载R CMD check。以下两种方式都使lattice看起来像未声明的依赖关系,并将返回以下错误。

##' @import lattice
{}

##' Visualization
##'
##' @param x Data.
##' @param y More data.
##' @export
vizz <- function(x, y){
    xyplot(y ~ x)
}




##' Visualization
##'
##' @param x Data.
##' @param y More data.
##' @export
vizz <- function(x, y){
    library(lattice)
    xyplot(y ~ x)
}


两者都给出相同的错误

$ R CMD check dummy.roxygen

* using log directory ‘/###/dummy.roxygen.Rcheck’
* using R version 3.0.2 (2013-09-25)
* using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
* using session charset: UTF-8
* checking for file ‘dummy.roxygen/DESCRIPTION’ ... OK
* checking extension type ... Package
* this is package ‘dummy’ version ‘1.0-0’
* package encoding: UTF-8
* checking package namespace information ... OK
* checking package dependencies ... ERROR
Namespace dependencies not required: ‘lattice’

See the information on DESCRIPTION files in the chapter ‘Creating R
packages’ of the ‘Writing R Extensions’ manual.


由于对“ roxygen”一词的搜索与“ suggests”,“ depends”和“ imports”结合使用会返回大量无关的点击,因此,我一直在寻找答案已经很长时间了。同时,我刚刚列出了lattice和许多其他不错但非重要的软件包作为依赖项,但是现在当我要发布软件包时,我想以适当的方式解决它。

最佳答案

建议(在2013年,当我第一次写这个答案时)是有条件陈述中对require的建议。现在在2016年,the official recommendation将使用::并让R打印there is no package called X错误:

##' Visualization
##'
##' @description Visualize the data. \pkg{\link{lattice}} package required.
##' @param x Data.
##' @param y More data.
##' @seealso \pkg{\link{lattice}}
##' @export
vizz <- function(x, y){
    lattice::xyplot(y ~ x)
}


并且只能将Suggests: lattice保留在DESCRIPTION中(import中不要NAMESPACE)。

如果要自定义错误消息,现在可以在条件语句中使用requireNamespace(lattice),例如:

vizz <- function(x, y){
    if (! requireNamespace("lattice", quietly = TRUE)) {
        stop("Please install lattice: install.packages('lattice')")
    lattice::xyplot(y ~ x)
}

09-05 14:50