我在Wiki中寻找如何转换有关磁珠，笛卡尔坐标+能量的以下信息:
23.4 54.6 12.3 -123.5 54.5 23.1 9.45 -56.7 .......
绘制为pymol，其中每个原子包含一个半径为R的球体，半径为R，以其坐标为中心，并且颜色呈彩虹渐变。
谢谢
最佳答案
您渲染的内容实际上与分子结构有什么关系吗(即使用PyMol的动机是什么？)？
如果您要绘制一些分子结构，我建议您仅输出一个具有球坐标的自定义PDB文件(您可以将每条ATOM线的B因子字段用作控制PyMol中每原子着色的一种方式)。
如果您不绘制分子结构，则最好使用PyMol的CGO界面。
从PyMol文档中:
一个简单的例子:
from pymol.cgo import *
from pymol import cmd
spherelist = [
COLOR, 0.100, 1.000, 0.000,
SPHERE, 30.304, 30.407, 30.531,0.30,
COLOR, 1.000, 0.000, 0.000,
SPHERE, 30.250, 30.250, 30.250,0.20,
]
cmd.load_cgo(spherelist, 'segment', 1)
关于python - 在pymol中从笛卡尔坐标绘制彩色球体，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/2060582/