我正在尝试使用纯素食软件包在R中执行NMDS，该软件包将图作为列，而物种计数作为列。我的数据采用文本文件格式(制表符分隔)，并且包含很多“0”种类计数。但是，当我尝试创建距离矩阵时，出现以下错误消息:
bray <- vegdist(data1, method = "bray")
这使我无法执行NMDS:
nmds <- metaMDS(data1, k = 2,
+ distance = 'bray', autotransform = FALSE)
我怎样才能解决这个问题？
谢谢您的回答!
最佳答案
有些列仅包含0个计数。删除这些使其起作用