c++ - 将dnorm与RcppArmadillo一起使用

从R，我试图在此文件上运行sourceCpp:

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

using namespace arma;
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
vec dnormLog(vec x, vec means, vec sds) {
    int n = x.size();
    vec res(n);
    for(int i = 0; i < n; i++) {
        res[i] = log(dnorm(x[i], means[i], sds[i]));
    }
return res;
}

请参阅this answer，以查看从何处获得函数。这将引发错误:
no matching function for call to 'dnorm4'
这是我希望通过使用循环来避免的确切错误，因为引用的答案提到dnorm仅针对其第一个参数进行矢量化。我担心答案很明显，但是我尝试在R::之前添加dnorm，尝试使用NumericVector而不是vec，而不在前面使用log()。没运气。但是，在R::之前添加dnorm确实会产生单独的错误:

too few arguments to function call, expected 4, have 3; did you mean '::dnorm4'?

不能通过将上面的dnorm替换为R::dnorm4来解决。

最佳答案

这里有两个不错的可教导的时刻:

注意 namespace 。如有疑问，请不要全局化。

检查标题中的实际定义。您错过了标量版本R::dnorm()中的第四个参数。

这是一个修复的版本，其中包括第二个变体，您可能会发现它很有趣:

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

// [[Rcpp::export]]
arma::vec dnormLog(arma::vec x, arma::vec means, arma::vec sds) {
  int n = x.size();
  arma::vec res(n);
  for(int i = 0; i < n; i++) {
    res[i] = std::log(R::dnorm(x[i], means[i], sds[i], FALSE));
  }
  return res;
}

// [[Rcpp::export]]
arma::vec dnormLog2(arma::vec x, arma::vec means, arma::vec sds) {
  int n = x.size();
  arma::vec res(n);
  for(int i = 0; i < n; i++) {
    res[i] = R::dnorm(x[i], means[i], sds[i], TRUE);
  }
  return res;
}


/*** R
dnormLog( c(0.1,0.2,0.3), rep(0.0, 3), rep(1.0, 3))
dnormLog2(c(0.1,0.2,0.3), rep(0.0, 3), rep(1.0, 3))
*/

当我们获得此结果时，两者都返回相同的结果，因为R API允许我们要求采用对数。

R> sourceCpp("/tmp/dnorm.cpp")

R> dnormLog( c(0.1,0.2,0.3), rep(0.0, 3), rep(1.0, 3))
          [,1]
[1,] -0.923939
[2,] -0.938939
[3,] -0.963939

R> dnormLog2(c(0.1,0.2,0.3), rep(0.0, 3), rep(1.0, 3))
          [,1]
[1,] -0.923939
[2,] -0.938939
[3,] -0.963939
R>