R绘图fill.contour()在ggplot2中输出

我想绘制使用filled.contour()创建的图，但是在ggplot2中，我该怎么做？

我想使用ggplot2，因为绘图约定更容易。我之所以要使用filled.contour()，是因为我尝试了geom_tile()和image.plot()，它们都创建了非常像图块的输出，并且我需要一个类似于fill.contour()的输出。

这是我的身材:

代码:

library(akima)

df <-read.table("Petra_phytoplankton+POM_xydata_minusNAs_noduplicates.txt",header=T)
attach(df)
names(df)
fld <- with(df, interp(x = longitude, y = latitude, z = d13C))

filled.contour.ungeoreferenced <-
  (filled.contour(x = fld$x,
                  y = fld$y,
                  z = fld$z,
                  color.palette =
                    colorRampPalette(c("blue", "green", "yellow",
                                       "orange", "red")),
                  xlab = "Longitude",
                  ylab = "Latitude",
                  key.title = title(main = "d13C",
                                    cex.main = 1)))

数据段:

latitude    longitude   d13C
-65 -70 -27.7
-61 150 -32.2
-61 150 -28.3
-60 116 -26.8
-60 116 -24.7
-47 38  -24.8
-38 150 -20.5
19  -65.7   -19.9
19  -65.5   -18.5
18  -60.7   -20
18  -58.5   -18.2
18  -57.8   -19
17  -55.4   -18.6
17  -50.8   -18
17  -47.1   -18.3
17  -45.5   -19.4
16  -43.3   -17.9
15  -40.7   -18.5
14  -39.3   -19.9
12  -36.7   -19.9
12  -36.2   -19.9
11  -34.4   -19.2
10  -32 -18.5
9   -30.3   -19.3
8   -29.2   -19.4
7   -26.6   -18.2
7   -25.5   -19.3
6   23.9    -20
3   -21.3   -20.4

最佳答案

您可以根据需要调整颜色:

gdat <- interp2xyz(fld, data.frame=TRUE)

ggplot(gdat) +
  aes(x = x, y = y, z = z, fill = z) +
  geom_tile() +
  coord_equal() +
  geom_contour(color = "white", alpha = 0.5) +
  scale_fill_distiller(palette="Spectral", na.value="white") +
  theme_bw()

您可以通过增加插值的密度来减少像素化，但会花费一些处理时间:

fld <- with(df, interp(x = longitude,
                       y = latitude,
                       z = d13C,
                       xo = seq(min(longitude), max(longitude), length=400),
                       duplicate="mean"))

并减小垃圾箱宽度:

ggplot(gdat) +
  aes(x = x, y = y, z = z) +
  geom_tile(aes(fill=z)) +
  coord_equal() +
  stat_contour(aes(fill=..level..), geom="polygon", binwidth=0.005) +
  geom_contour(color="white", alpha=0.5) +
  scale_fill_distiller(palette="Spectral", na.value="white") +
  theme_bw()

注意:在一个体面的台式机系统上，这将花费几秒钟的时间。在我相当强大的MacBook Pro上，它是:

   user  system elapsed
  6.931   0.655   8.153

关于R绘图fill.contour()在ggplot2中输出，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/28330821/