我正在尝试使用SWIG为python包装一个C库。我在使用标准系统工具链的Linux 64位系统(Gentoo)。库(SUNDIALS)与/usr/local/lib中的共享库一起安装在我的系统上

我的界面文件很简单(开头)

%module nvecserial

%{
#include "sundials/sundials_config.h"
#include "sundials/sundials_types.h"
#include "sundials/sundials_nvector.h"
#include "nvector/nvector_serial.h"
%}

%include "sundials/sundials_config.h"
%include "sundials/sundials_types.h"
%include "sundials/sundials_nvector.h"
%include "nvector/nvector_serial.h"


给定上面的接口文件,我运行

$ swig -python -I/usr/local/include nvecserial.i
$ gcc -O2 -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c nvecserial_wrap.c
$ gcc -shared /usr/local/lib/libsundials_nvecserial.so nvecserial_wrap.o -o _nvecserial.so
$ python -c "import nvecserial"
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
  File "nvecserial.py", line 28, in <module>
    _nvecserial = swig_import_helper()
  File "nvecserial.py", line 24, in swig_import_helper
    _mod = imp.load_module('_nvecserial', fp, pathname, description)
ImportError: ./_nvecserial.so: undefined symbol: N_VLinearSum


一点挖掘仔细检查事情表明

$ objdump -t /usr/local/lib/libsundials_nvecserial.so |grep Linear
0000000000001cf0 g     F .text  00000000000002e4              N_VLinearSum_Serial
$ objdump -t _nvecserial.so |grep Linear
00000000000097e0 l     F .text  0000000000000234              _wrap_N_VLinearSum
000000000000cd10 l     F .text  0000000000000234              _wrap_N_VLinearSum_Serial
0000000000000000         *UND*  0000000000000000              N_VLinearSum
0000000000000000       F *UND*  0000000000000000              N_VLinearSum_Serial


据我所知,N_VLinearSum是N_VLinearSum_Serial的包装(也有并行实现,因此nvecparallel中的N_VLinearSum可以包装N_VLinearSum_Parallel)。我迷路的地方是下一步。这是我的接口定义问题还是编译问题?

最佳答案

我们将通过链接一个额外的库来使其工作。看来libsundials_nvecserial.so和弟兄们不包含符号N_VLinearSum。 SUNDIALS使过程将sundials_nvector.h中的功能和符号放置到不同的.so文件中,这在某种程度上是直观的。

现在,我已经与

$ gcc -shared -L/usr/local/lib nvecserial_wrap.o -o _nvecserial.so\
-lsundials_nvecserial -lsundials_cvode
$ python -c "import nvecserial"
$


我将继续处理源代码分发中的实际.o文件,但考虑到最终使用distutils分发包装模块的意图,并且并不是每个人都可以访问其系统上的SUNDIALS源,我可能会坚持使用链接到额外的共享库中。

10-06 00:56