我有250个对象，并且使用h <- hclust(distance.matrix, method = "single")获取hclust对象。如果我从h绘制树状图，那是一个烂摊子，因为有太多的对象，并且标签被挤压在一起。
假设我对特定的群集组感兴趣
现在，我知道我们可以通过指定所需的组数，使用cutree将一棵树（例如由hclust产生的树）切成几组。
但是，如何才能分别为R中的那些较小的群集组获得树状图？
最佳答案
您可以将hclust对象转换为dendrogram并使用cut（有关详细信息，请参见?cut.dendrogram）：
hc <- hclust(dist(USArrests), "ave")
plot(hc)
## cut at height == 100
d <- cut(as.dendrogram(hc), h=100)
## cut returns a list of sub-dendrograms
d
#$upper
#'dendrogram' with 2 branches and 2 members total, at height 152.314
#
#$lower
#$lower[[1]]
#'dendrogram' with 2 branches and 16 members total, at height 77.60502
#$lower[[2]]
#'dendrogram' with 2 branches and 34 members total, at height 89.23209
par(mfrow=c(1, 2))
plot(d$lower[[1]])
plot(d$lower[[2]])
par(mfrow=c(1, 1))