我在mysql数据库中有许多摘要表。数据库名称的标签如下。我已经创建了这些文件名的列表-
数据库名称列表

AAA_1
AAA_2
AAA_3
AAA_4
AAA_5
AAA_6
AAA_7

每个数据库都包含一个摘要表。它们的名称如下所示,并以list-querylist的形式
AAA_1_Summary
AAA_2_Summary
AAA_3_Summary
AAA_4_Summary
AAA_5_Summary
AAA_6_Summary
AAA_7_Summary

每个表都有一组变量。我在变量上运行一个随机林。
表AAA_1
   Variable1    Variable2   Variable3   Outcome
     A           1           123         100
     B           2           145         150
     C           3           167         130
     D           4           111         111
     A           5           133         123
     B           6          131.6        111

我想通过RMySQL查询和for循环导入每个表。我想在每个表上分别运行一个随机林,输出应该写入一个单独的文件系列。
我试过下面的代码
  require(RMySQL)# Import library
  require(DBI)# import library
  require(sqldf)# import library
  require(dbConnect)
  username = 'username'
  userpass = 'userpass'
  hostname = '111.11.11.1111'

  for (i in databasenameslist){
                      cdb<-i}
 for(i in querylist){
                      Query<- i}

  cdbconn = dbConnect(MySQL(), user=username, password=userpass,
  dbname=cdb[i],
  host=hostname)

上述步骤是分别连接每个数据库。现在必须读取每个文件。为此,我使用以下代码。
数据库上面的代码不起作用。
注:最终解决方案类似于此代码:Write many files in a for loop

最佳答案

考虑Map遍历两个list元素,因为不需要嵌套循环。另外,将SELECT * FROM添加到您的querylist名称以发送appropariate SQL调用。

# IF QUERYLIST IS A CHARACTER VECTOR
querylist <- paste0("SELECT * FROM ", querylist)

# IF QUERYLIST IS A LIST
querylist <- lapply(querylist, function(q) paste0("SELECT * FROM ", q))

proc_data <- function(db, qry) {
   conn <- dbConnect(MySQL(), user=username, password=userpass, dbname=db, host=hostname)
   df <- dbGetQuery(conn, qry)
   dbDisconnect(conn)

   # ... DO OTHER WORK ON DF: random forest, csv output

   return(df)    # OR WHATEVER OTHER OBJ IN PROCESSING
}

df_List <- Map(proc_data, databasenameslist, querylist)

08-19 19:57