python - 艾伦大脑研究所-脑观测站示例

我试着以brain observatory ipython notebook为例。
但是，我在加载nwb文件时遇到了如下问题。

from allensdk.core.brain_observatory_cache import BrainObservatoryCache
boc = BrainObservatoryCache(manifest_file='boc/manifest.json')

data_set = boc.get_ophys_experiment_data(501940850)  # problem here

所以，我通过HDFview打开了nwb文件。
除了nwb之外，所有的脑天文台502376461.nwb文件都没有打开。
当我试图打开艾伦的ipython笔记本示例中的502376461.nwb时，它成功了！！但是其他的（501940850，503820068…）都失败了。

最佳答案

总结github中的线程：
https://github.com/AllenInstitute/AllenSDK/issues/22
这些文件被部分下载或以某种方式损坏。下载期间未报告异常，因此urllib一定没有注意到问题。
AllenSDK开发人员正在研究某种文件一致性检查和/或不同的HTTP库。
https://github.com/AllenInstitute/AllenSDK/issues/28
如果其他人遇到这种情况，您可以删除坏文件并重新运行下载功能（BrainObservatoryCache.get_ophys_experiment_data）。文件下载到BrainObservatoryCachemanifest file的子目录中，如果未指定，则默认为当前工作目录。

关于python - 艾伦大脑研究所-脑观测站示例，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题：https://stackoverflow.com/questions/39092740/