图中左侧为工作区，右侧为版本库。在版本库中标记为index的区域为暂存区，标记为master的是master分支所代表的目录树。
图中可以看出， 此时HEAD实际是指向master分支的一个“游标”，所以图示的命令中出现HEAD的地方可以用master来替换。
途中的objects标识的区域为git的对象库，世纪位于 .git/objects目录下。
当对工作区修改（或新增）的文件执行git add命令时，暂存区的目录树会被更新，同时工作区修改（或新增）的文件内容会被写入到对象库中的一个新的对象中，而该对象的id被记录在暂存区的文件索引中。
当执行提交操作（git commit）时，暂存区的目录树会写到版本库（对象库）中，master分支会做相应的更新，即master最新指向的目录树就是提交时原暂存区的目录树。
当执行git reset HEAD命令时，暂存区的目录树会被重写，会被master分支指向的目录树所替换，但是工作区不受影响。
当执行git rm --cached 命令时，会直接从暂存区删除文件，工作区则不做出改变。
当执行git checkout .或git checkout -- 命令是，会用暂存区全部的文件或指定的文件替换工作区的文件。这个操作很危险，会清楚工作区中未添加到暂存区的改动。
当执行git checkout HEAD .或git checkout HEAD 命令时，会用HEAD指向的master分支中的全部或部分文件替换暂存区和工作区中的文件。这个命令也是极度危险的。因为不但会清楚工作区中未提交的改动，也会清楚暂存区中未提交的改动。
ps：摘抄自《git权威指南》