所以我试图创建序列的补充
TGAGACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTCTGTGTGC
但是我的输出没有按预期工作。
序列中每个字母的补码是
A -> T
G -> C
C -> G
T -> A
我已经用 Java 编程一年多了,所以我对 C++ 中的指针真的很生疏,我猜问题在于反向方法,指针的方式在函数调用的每次传递中都发生了变化
#include<stdio.h>
#include<iostream>
using namespace std;
void reverse(char s[]);
int main() {
char s[40] = {'T','G','A','G','A','C','T','T','C','A','G','G','C','T','C','C','T','G','G','G','C','A','A','C','G','T','G','C','T','G','G','T','C','T','G','T','G','T','G'};
cout << "DNA sequence: "<< endl << s << endl;
reverse(s);
cout << "Reverse Compliment: "<< endl << s << endl;
system("pause");
}
void reverse(char s[])
{
char c;
char *p, *q;
p = s;
if (!p)
return;
q = p + 1;
if (*q == '\0')
return;
c = *p;
reverse(q);
switch(c) {
case 'A':
*p = 'T';
break;
case 'G':
*p = 'C';
break;
case 'C':
*p = 'G';
break;
case 'T':
*p = 'A';
break;
}
while (*q != '\0') {
*p = *q;
p++;
q++;
}
*p = c;
return;
}
最佳答案
标准的现代 C++ 使这种低级的、面向指针的编程变得不必要(实际上,您正在有效地编写 C)。
一旦你有了一个函数,比如 complement
,它将一个核苷酸转换成它的补码,你只需要应用一些标准库函数,比如 transform
。
这是用 C++11 重写的程序:
#include <string>
#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <cassert>
using namespace std;
char complement(char n)
{
switch(n)
{
case 'A':
return 'T';
case 'T':
return 'A';
case 'G':
return 'C';
case 'C':
return 'G';
}
assert(false);
return ' ';
}
int main()
{
string nucs = "ACAATTGGA";
transform(
begin(nucs),
end(nucs),
begin(nucs),
complement);
cout << nucs << endl;
}
关于c++ - 创建 DNA 序列的补充并将其反转 C++,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/33074574/