我正在使用汽车包装中的散点图函数来生成散点图。
我希望能够在绘图中生成应该为x = y的引用线。
我尝试使用abline,它确实添加了一行,但它不是x = y行。有人可以帮忙吗?
我的代码如下:
scatterplot(phenos$P1~pheno$P0, data=pheno,spread=FALSE,ylab="6 month timepoint", xlab="Baseline Timepoint", jitter=list(x=1, y=1))
abline(0,1)
谢谢。
最佳答案
实际上,这是相当困难的/骇人听闻的,因为scatterplot()
在内部使用layout
,这使得很难控制图形驱动程序当前正在使用的子图。 (更新:这比我想象的要难-设置par("mfg")
一定是偶然地起作用了。)
组成数据(更新:使用均值x和y不等于零且彼此不相等的数据,因为它更清楚地说明了单纯使用abline()
的困难)
set.seed(1)
d <- data.frame(x=rnorm(10,mean=10),y=rnorm(10,mean=12))
library(car)
尝试我的旧策略(该策略实际上不起作用,或者只能以不可预测的方式起作用):
scatterplot(y~x,data=d,reset.par=FALSE)
k <- 1
for (i in 1:2) {
for (j in 1:2) {
par(mfg=c(i,j,2,2))
abline(0,1,lwd=3,col=k)
k <- k+1
}
}
根据我的操作方式,我会收到警告和错误,也可能会得到虚假的答案。我是否在函数内执行
scatterplot()
似乎很重要... ??第二次尝试,更加保守:从头开始重新构建布局。
scatterplot(y~x,data=d)
uu <- par("usr")
## mimic layout frolm car:::scatterplot.default. Would be different if we were drawing only one
## of x-boxes or y-boxes
layout(matrix(c(1, 0, 3, 2), 2, 2), widths = c(5, 95),
heights = c(95, 5))
oldmar <- par(mar=rep(0,4)) ## zero out margins so we can plot in sub-boxes without errors
## now skip through the first two sub-plots
par(new=TRUE); plot.new(); par(new=TRUE); plot.new()
par(oldmar) ## reset margins
## blank plot with user limits set and 'interior' axis calculations
plot(0:1,0:1,xlab="",ylab="",xlim=uu[1:2],ylim=uu[3:4],xaxs="i",yaxs="i")
## add annotation
abline(a=0,b=1,col=4,lwd=3)
考虑到此解决方案的工作量和脆弱性,实际上最好是破解
scatterplot
以有选择地允许另外指定abline()
或向维护者索要该功能……