我想使用mutate使用二项分布来计算列。

我有以下示例:

library("dplyr")

d = data.frame(ref = rbinom(100,100,0.5))
d$coverage = 100
d$prob = 0.5
d$eprob= d$ref / d$coverage
d = tbl_df(d)

mutate(d,
       ref1= ref,
       cov1 = coverage,
       eprob1 = eprob,
       ref2=rbinom(1, coverage, eprob),
       ref3=rbinom(1, cov1, eprob1)
       )

结果是这样的:
Source: local data frame [100 x 9]

   ref coverage prob eprob ref1 cov1 eprob1 ref2 ref3
1   52      100  0.5  0.52   52  100   0.52   45   44
2   50      100  0.5  0.50   50  100   0.50   45   44
3   45      100  0.5  0.45   45  100   0.45   45   44
4   45      100  0.5  0.45   45  100   0.45   45   44
5   47      100  0.5  0.47   47  100   0.47   45   44
6   46      100  0.5  0.46   46  100   0.46   45   44
7   50      100  0.5  0.50   50  100   0.50   45   44
8   53      100  0.5  0.53   53  100   0.53   45   44
9   44      100  0.5  0.44   44  100   0.44   45   44
10  56      100  0.5  0.56   56  100   0.56   45   44

我不明白-我想让mutate函数返回从ref和coverage(“ref2”)给定的二项式分布得出的随机数...

Mutate正确读取了列-但是在调用rbinom时发生了一些奇怪的事情...

任何帮助,我表示赞赏。

最佳答案

尝试更改nrbinom:

mutate(d,
   ref1= ref,
   cov1 = coverage,
   eprob1 = eprob,
   ref2=rbinom(100, coverage, eprob),
   ref3=rbinom(100, cov1, eprob1)
)

或更笼统地说:
mutate(d,
   ref1= ref,
   cov1 = coverage,
   eprob1 = eprob,
   ref2=rbinom(n(), coverage, eprob),
   ref3=rbinom(n(), cov1, eprob1)
)

关于r - 使用rbinom的dplyr mutate不返回随机数,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题:https://stackoverflow.com/questions/31878389/

10-12 18:00